More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1858 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  100 
 
 		 396 aa  770    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  64.87 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  55.93 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  50.53 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  52.43 
 
 		 400 aa  309  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 391 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  47.49 
 
 		 600 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  47.58 
 
 		 422 aa  272  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  47.21 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  44.28 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  47.3 
 
 		 402 aa  270  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  45.55 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  46.15 
 
 		 383 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  43.28 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  46.45 
 
 		 395 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  42.49 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  42.31 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  49.06 
 
 		 446 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  44.99 
 
 		 376 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  45.48 
 
 		 424 aa  243  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  44.99 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  43.5 
 
 		 384 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  44.53 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  44.99 
 
 		 376 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  42.04 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  48.09 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  44.95 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  43.38 
 
 		 371 aa  226  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  41.58 
 
 		 374 aa  224  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  45.4 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  45.38 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  43.64 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  41.69 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  47.66 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  46.18 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  37.62 
 
 		 423 aa  196  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  37.78 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  45 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  43.42 
 
 		 385 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.6 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  45.25 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  43.57 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  38.83 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  34.75 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  39.26 
 
 		 389 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  40.08 
 
 		 361 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  39.91 
 
 		 514 aa  152  7e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  43.26 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  32.89 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  34.52 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  39.16 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  39.68 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  43.26 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  43.52 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  39.68 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  43.26 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  39.68 
 
 		 433 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  43.61 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  39.68 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  39.68 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  44.7 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  44.24 
 
 		 422 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  39.36 
 
 		 374 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  38.74 
 
 		 399 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  44.24 
 
 		 475 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  35.74 
 
 		 367 aa  149  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  40.55 
 
 		 370 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  44.02 
 
 		 229 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.56 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  43.78 
 
 		 475 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  42.34 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  41.94 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  41.55 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 422 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  39.35 
 
 		 336 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  31.16 
 
 		 374 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  30.46 
 
 		 364 aa  146  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  28.15 
 
 		 360 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  42.73 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  34.39 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  31.48 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  41.45 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  36.02 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  27.48 
 
 		 360 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  35.86 
 
 		 366 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  33.44 
 
 		 366 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0678  putative DNA uptake protein  39.22 
 
 		 514 aa  142  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  39.18 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  39.51 
 
 		 375 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  41.15 
 
 		 372 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  39.81 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  30.49 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  41.47 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  36.09 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  36.66 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  39.6 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  30.98 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>