More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3415 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 387 aa  746    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  58.06 
 
 		 475 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  56.19 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  53.26 
 
 		 394 aa  346  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  50.89 
 
 		 444 aa  298  9e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  51.17 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  48.46 
 
 		 452 aa  288  8e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  50.66 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  48.29 
 
 		 600 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  47.92 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  47.06 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  49.23 
 
 		 422 aa  272  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  48.97 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  48.82 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  48.28 
 
 		 395 aa  249  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  45.67 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  47.76 
 
 		 446 aa  246  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  45.05 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  43.94 
 
 		 388 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  46.11 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  45.29 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  45.29 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  45.29 
 
 		 376 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  48.73 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  40.36 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  45.38 
 
 		 371 aa  223  6e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  43.44 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  42.27 
 
 		 402 aa  222  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  41.84 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  43.26 
 
 		 388 aa  216  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  42.35 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  47.92 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  41.29 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  49.54 
 
 		 395 aa  199  9e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  43.42 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  43.2 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  36.63 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  40.13 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.55 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  46.49 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  40.19 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  46.49 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  46.49 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  46.49 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  46.49 
 
 		 434 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  46.29 
 
 		 434 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  46.49 
 
 		 434 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  46.05 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.34 
 
 		 368 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  40.26 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  46.72 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  34.55 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  46.29 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.84 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  46.32 
 
 		 422 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  41 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  43.72 
 
 		 422 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  42.33 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  46.29 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  42.86 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  46.98 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  40.16 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  34.69 
 
 		 514 aa  157  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  35.04 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.23 
 
 		 362 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  37 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  38.25 
 
 		 364 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  37.24 
 
 		 361 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  37.26 
 
 		 359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  45.85 
 
 		 475 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  45.02 
 
 		 422 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  38.83 
 
 		 394 aa  156  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  45.63 
 
 		 377 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  42.15 
 
 		 369 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  37.24 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  44.14 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  34.8 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  34.68 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  38.7 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  34.46 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  34.31 
 
 		 370 aa  153  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  34.34 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  37.94 
 
 		 382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  34.34 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  37.11 
 
 		 372 aa  152  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  39.6 
 
 		 356 aa  152  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  39.08 
 
 		 399 aa  152  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  34.34 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  37.74 
 
 		 374 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  43.95 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  36.71 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  37.78 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  34.12 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  39.72 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  34.12 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0678  putative DNA uptake protein  39.51 
 
 		 514 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  36.09 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  40.86 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  42.73 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>