More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11160 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 371 aa  714    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  46.97 
 
 		 402 aa  246  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  45.15 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.38 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  45.93 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  45.74 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  46.44 
 
 		 402 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  43.39 
 
 		 475 aa  236  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  43.96 
 
 		 391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  45.38 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  48.77 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  44.35 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  49.15 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  44.97 
 
 		 444 aa  226  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  43.22 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  42.75 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  44.38 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  47.08 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  42.69 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  41.62 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  41.83 
 
 		 600 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  40.49 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  43.94 
 
 		 408 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  42.23 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  42.23 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  42.12 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  44.29 
 
 		 428 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  42.41 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  45.97 
 
 		 400 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  43.32 
 
 		 446 aa  193  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  47.22 
 
 		 388 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  44.4 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  47.28 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  41.49 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  40.38 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  43.23 
 
 		 424 aa  178  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  42.55 
 
 		 389 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  34.69 
 
 		 370 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  49.12 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  41.45 
 
 		 375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  37.74 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  45.7 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  40.48 
 
 		 361 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  39.06 
 
 		 386 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  37.75 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  39.66 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  39.19 
 
 		 362 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  38.52 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 368 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  35.88 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  36.96 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  37.55 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  35.58 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  39.48 
 
 		 374 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  36.27 
 
 		 380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  42.29 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  40.83 
 
 		 379 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  30.84 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  40.56 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  38.11 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  45.29 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  39.48 
 
 		 389 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  36.95 
 
 		 372 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  39.85 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  40.47 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  43.3 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  35.79 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.05 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  36.8 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  39.52 
 
 		 425 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  33.11 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  39.06 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  38.49 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  32.78 
 
 		 406 aa  150  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.2 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  36.24 
 
 		 514 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  32.62 
 
 		 356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  42.72 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  44.2 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  37.33 
 
 		 359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  38.86 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  39.41 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  37.7 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  32.4 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  40.81 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  35.12 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  33.6 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  32.8 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  36.49 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  42.33 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  41.4 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  35.8 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  38.91 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  39.62 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  43.66 
 
 		 422 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  38.91 
 
 		 399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  43.19 
 
 		 422 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>