More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1524 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 600 aa  1147    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  49.74 
 
 		 475 aa  293  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  47.49 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  47.8 
 
 		 387 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  46.63 
 
 		 391 aa  266  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  50.16 
 
 		 394 aa  258  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  47.68 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  45.39 
 
 		 422 aa  236  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  49.54 
 
 		 383 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  45.41 
 
 		 402 aa  231  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  42.09 
 
 		 444 aa  230  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  51.85 
 
 		 384 aa  230  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  47.63 
 
 		 379 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  47 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  48.58 
 
 		 399 aa  221  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  47.68 
 
 		 374 aa  221  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  44.33 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  44.05 
 
 		 408 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  47.01 
 
 		 378 aa  216  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  42.57 
 
 		 452 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  43.68 
 
 		 386 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  48.44 
 
 		 376 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  48.44 
 
 		 376 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  48.44 
 
 		 376 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  43.65 
 
 		 424 aa  213  7e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  46.25 
 
 		 446 aa  210  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  41.01 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  45.21 
 
 		 394 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  44.48 
 
 		 349 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  42.12 
 
 		 400 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  39.25 
 
 		 423 aa  197  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  41.9 
 
 		 389 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  42.26 
 
 		 371 aa  189  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  46.96 
 
 		 310 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  42.6 
 
 		 388 aa  185  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  42.21 
 
 		 358 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  37.87 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  42.08 
 
 		 428 aa  177  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  43.56 
 
 		 422 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  44.48 
 
 		 475 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  46.79 
 
 		 422 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  45.72 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  45.72 
 
 		 434 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  44.16 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  45.42 
 
 		 422 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  45.85 
 
 		 338 aa  171  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  46.94 
 
 		 434 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  46.94 
 
 		 434 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  46.94 
 
 		 396 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  46.94 
 
 		 396 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  54.07 
 
 		 361 aa  170  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  48.67 
 
 		 433 aa  170  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  46.94 
 
 		 434 aa  170  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  44.3 
 
 		 448 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  40.84 
 
 		 372 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  46.32 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  34.3 
 
 		 370 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  45.89 
 
 		 422 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  36.88 
 
 		 389 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  53.08 
 
 		 377 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  38.71 
 
 		 386 aa  163  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  40.14 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  41.47 
 
 		 409 aa  163  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  44.17 
 
 		 405 aa  162  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  43.29 
 
 		 389 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  48.31 
 
 		 379 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  45.64 
 
 		 375 aa  161  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  37.67 
 
 		 367 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  40.48 
 
 		 389 aa  160  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  34.92 
 
 		 362 aa  160  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  37.66 
 
 		 382 aa  158  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  46.6 
 
 		 229 aa  158  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.3 
 
 		 336 aa  158  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  47.73 
 
 		 338 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  42.68 
 
 		 375 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 		 371 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  37.67 
 
 		 359 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  37.19 
 
 		 359 aa  157  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  39.79 
 
 		 368 aa  157  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  38.22 
 
 		 368 aa  157  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  47.14 
 
 		 395 aa  157  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  46.54 
 
 		 592 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  37.5 
 
 		 425 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.48 
 
 		 362 aa  156  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  45.21 
 
 		 366 aa  156  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  41.43 
 
 		 330 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  36.9 
 
 		 366 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  45.04 
 
 		 394 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  41.92 
 
 		 339 aa  154  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  31.63 
 
 		 356 aa  154  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  48.31 
 
 		 338 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  47.75 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  33.85 
 
 		 748 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  46.86 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  38.22 
 
 		 365 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  38.18 
 
 		 363 aa  152  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 331 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  45.21 
 
 		 338 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  47.75 
 
 		 338 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>