More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1318 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 444 aa  860    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  79.87 
 
 		 452 aa  669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  52.36 
 
 		 384 aa  329  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  52.96 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 387 aa  294  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  45.98 
 
 		 475 aa  272  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.28 
 
 		 396 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  46.56 
 
 		 391 aa  269  8.999999999999999e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  46.05 
 
 		 383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  43.76 
 
 		 408 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  42.03 
 
 		 394 aa  246  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  42.56 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  47.24 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  45.66 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  42.09 
 
 		 600 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  46.75 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  42.96 
 
 		 446 aa  229  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  42.55 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  42.55 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  42.55 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  45.16 
 
 		 310 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  43.94 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  43.26 
 
 		 378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  44.26 
 
 		 349 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 388 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  42.39 
 
 		 402 aa  216  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  40.14 
 
 		 423 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  41.8 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  44.97 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  43.99 
 
 		 389 aa  207  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  39.85 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  39.29 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  37.67 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  36.7 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  39.36 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  33.44 
 
 		 374 aa  167  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  36.96 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  31.09 
 
 		 370 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  31.78 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  31.91 
 
 		 362 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  38.11 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  41.85 
 
 		 361 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.67 
 
 		 356 aa  156  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  40.32 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  34.82 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  37.85 
 
 		 358 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  34.5 
 
 		 359 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  38.08 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  33.6 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  38.62 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  35.78 
 
 		 371 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  31.27 
 
 		 368 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  30.56 
 
 		 409 aa  144  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  34.14 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  36.89 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  34.14 
 
 		 373 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  25 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  30.27 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  37.01 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  38.08 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.44 
 
 		 362 aa  136  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  34.97 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  31.19 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  33.24 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  24.09 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  36.82 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  37.36 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  36.4 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  39.27 
 
 		 366 aa  134  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  35.92 
 
 		 360 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  46.02 
 
 		 365 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  34.23 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  33.95 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  31.62 
 
 		 748 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  36.39 
 
 		 379 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  34.7 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  38.58 
 
 		 365 aa  131  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  31.49 
 
 		 381 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  42.29 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  35.46 
 
 		 375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  30.99 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  29.8 
 
 		 364 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  36.6 
 
 		 389 aa  130  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  44.8 
 
 		 366 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  41.24 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  39.39 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  39.15 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  31.4 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  38.41 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  33.86 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  30.36 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  30.41 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  28.03 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  39.15 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  42.86 
 
 		 421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  38.78 
 
 		 320 aa  127  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  39.15 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 386 aa  127  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>