More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2268 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 349 aa  680    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4789  SMF family protein  73.89 
 
 		 252 aa  311  9e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  57.44 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  46.52 
 
 		 475 aa  239  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.4 
 
 		 396 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  45.54 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  48.16 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  50.84 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  44.26 
 
 		 444 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  51.02 
 
 		 394 aa  216  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  44.26 
 
 		 452 aa  216  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  48.52 
 
 		 446 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  45.08 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  49.15 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  43.61 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 387 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  51.37 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  44.38 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  44.48 
 
 		 600 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  44.67 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  44.41 
 
 		 374 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  43.63 
 
 		 402 aa  199  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  41.52 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  44.13 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  43.82 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  41.85 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  48.09 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  46.84 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  47.35 
 
 		 379 aa  185  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  45.42 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  42.76 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  41.12 
 
 		 423 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  42.11 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  48.05 
 
 		 376 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  48.05 
 
 		 376 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  41.02 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  45.67 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  40.34 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.25 
 
 		 370 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  41.33 
 
 		 514 aa  166  5e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  38.29 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  41.63 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  45.12 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  40.99 
 
 		 394 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  36.03 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  45.3 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  45.76 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.82 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  33.45 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  38.57 
 
 		 372 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  39.45 
 
 		 360 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  40.86 
 
 		 405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  45.05 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  42.42 
 
 		 385 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  39.57 
 
 		 370 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.13 
 
 		 362 aa  152  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  44.4 
 
 		 408 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  40.93 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  38.43 
 
 		 374 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  38.5 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  37.94 
 
 		 592 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  39.45 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  36.11 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  43.5 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  34.87 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  38.72 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.17 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  39.08 
 
 		 382 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  43.27 
 
 		 366 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  32.84 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  33.6 
 
 		 363 aa  149  9e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  31.31 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  43.46 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  42.13 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  40.09 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  37.76 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  36.27 
 
 		 375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  36.05 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  40.08 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  37.92 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  38.81 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  39.41 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  42.79 
 
 		 392 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  39.83 
 
 		 371 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  43.95 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  42.86 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  44.62 
 
 		 359 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  45.03 
 
 		 366 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  38.08 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  39.84 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  41.38 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  34.63 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 386 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  31.51 
 
 		 363 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  40.18 
 
 		 366 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  46.2 
 
 		 386 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  39.83 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  35.88 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  35.06 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>