More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1409 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 395 aa  738    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  52.69 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  48.73 
 
 		 394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  48.39 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  52.04 
 
 		 402 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  48.15 
 
 		 394 aa  280  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  47.3 
 
 		 475 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  51.08 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  49.48 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  46.45 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  50.68 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  49.86 
 
 		 376 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  49.86 
 
 		 376 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  47.68 
 
 		 600 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  47.61 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  47.49 
 
 		 387 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  46.32 
 
 		 374 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  49.87 
 
 		 422 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  46.86 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  48.29 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  46.68 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  45.71 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  47.61 
 
 		 378 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  51.07 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  47.04 
 
 		 384 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  52.55 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  48.77 
 
 		 371 aa  239  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  49.86 
 
 		 389 aa  239  8e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  44.13 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  43.95 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  46.86 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  45.31 
 
 		 446 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  44.14 
 
 		 423 aa  232  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  50.84 
 
 		 349 aa  227  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  46.41 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  41.48 
 
 		 395 aa  205  9e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  41.78 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  35.45 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  38.8 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  36.33 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  39.08 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  30.05 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  33.89 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  38.62 
 
 		 375 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  40.62 
 
 		 394 aa  159  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  38.12 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  33.89 
 
 		 364 aa  156  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  39.1 
 
 		 364 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.67 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  40.97 
 
 		 375 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  37.33 
 
 		 372 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  38.87 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  37.8 
 
 		 308 aa  153  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  30.52 
 
 		 374 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  40.33 
 
 		 375 aa  152  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  40.52 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  26.67 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  37.83 
 
 		 366 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  39.53 
 
 		 371 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  31.08 
 
 		 514 aa  149  8e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  47.67 
 
 		 360 aa  149  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  35.27 
 
 		 365 aa  149  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  42.45 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  31.7 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  28.05 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  42.11 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  37.4 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  36.58 
 
 		 373 aa  147  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  37.88 
 
 		 406 aa  146  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 387 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  35.81 
 
 		 368 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  29.41 
 
 		 366 aa  145  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  37.46 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  40.45 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.22 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  41.56 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  32.57 
 
 		 374 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  30.13 
 
 		 349 aa  142  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  42.62 
 
 		 434 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  34.09 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  39.85 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  36.93 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  46.97 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  35.12 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  42.62 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  42.62 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  48.19 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  26.05 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  39.74 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  42.62 
 
 		 434 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  42.62 
 
 		 396 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  42.62 
 
 		 396 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  42.24 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  42.62 
 
 		 434 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0678  putative DNA uptake protein  39.22 
 
 		 514 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  37.64 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  40.53 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>