More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2833 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 372 aa  708    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  52.13 
 
 		 388 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  55.83 
 
 		 372 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  56.01 
 
 		 372 aa  348  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  53.85 
 
 		 372 aa  345  8.999999999999999e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  52.16 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  52.01 
 
 		 383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  56.49 
 
 		 380 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  50.67 
 
 		 393 aa  339  4e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  50.13 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  55.71 
 
 		 372 aa  328  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  51.77 
 
 		 374 aa  328  7e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  54.35 
 
 		 380 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  53.26 
 
 		 378 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  53.53 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  47.12 
 
 		 396 aa  322  7e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  54.82 
 
 		 378 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  52.29 
 
 		 378 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  51.75 
 
 		 422 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  51.76 
 
 		 378 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  48.79 
 
 		 375 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  50.95 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  50.68 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  51.79 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  48.48 
 
 		 397 aa  299  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  48.22 
 
 		 397 aa  298  9e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  48.63 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  51.66 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  48.48 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  47.49 
 
 		 387 aa  297  3e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  50.93 
 
 		 395 aa  296  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  45.48 
 
 		 422 aa  295  7e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  41.24 
 
 		 375 aa  294  1e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  48.4 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  53.41 
 
 		 592 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  40.05 
 
 		 374 aa  289  6e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  44.34 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  49.57 
 
 		 402 aa  279  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  49.16 
 
 		 369 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  50.83 
 
 		 372 aa  272  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  46.04 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  45.43 
 
 		 418 aa  262  6e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  48.76 
 
 		 372 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  40.48 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  40.64 
 
 		 362 aa  246  4e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  44.73 
 
 		 358 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  43.25 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  41.19 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  42.39 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  42.82 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  45.33 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  43.93 
 
 		 387 aa  229  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  42.12 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  41.1 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  42.12 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  41.93 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  40.16 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  40.16 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  38.83 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  42.74 
 
 		 364 aa  226  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  40.96 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  42.82 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  43.05 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  42.3 
 
 		 401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  42.11 
 
 		 331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  41.67 
 
 		 366 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  35.44 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  43.54 
 
 		 375 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  41.85 
 
 		 366 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  38.59 
 
 		 366 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  41.73 
 
 		 394 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.02 
 
 		 409 aa  219  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  41.78 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  39.29 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  42.49 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  43.73 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  40 
 
 		 369 aa  216  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  41.11 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  39.37 
 
 		 373 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  38.78 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  38.9 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  41.4 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  41.64 
 
 		 368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  37.61 
 
 		 364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  41.4 
 
 		 365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  37.85 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  41.03 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  41.72 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  45.39 
 
 		 320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  41.38 
 
 		 340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  41.03 
 
 		 338 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  40.81 
 
 		 374 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  37.3 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  38.78 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  40.45 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  41.03 
 
 		 338 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  37.53 
 
 		 395 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  40.45 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  40.69 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>