More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0092 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  100 
 
 		 362 aa  730    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  50.79 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  51.06 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  41.44 
 
 		 378 aa  270  4e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  38.52 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  38.26 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 		 372 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  37.2 
 
 		 383 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  40.87 
 
 		 373 aa  242  9e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  41.78 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  40.48 
 
 		 372 aa  240  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  37.84 
 
 		 380 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  37.98 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  39.62 
 
 		 422 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  37.08 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  36.32 
 
 		 380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  38.01 
 
 		 372 aa  236  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  39.02 
 
 		 372 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  41.11 
 
 		 378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  38.78 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  38.04 
 
 		 378 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  40.23 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  38.1 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  39.89 
 
 		 360 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  36.81 
 
 		 396 aa  226  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  39.4 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  36.77 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  41.8 
 
 		 592 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  35.79 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  36.13 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  38.12 
 
 		 374 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  36.2 
 
 		 397 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  34.05 
 
 		 429 aa  216  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  42.05 
 
 		 422 aa  210  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  37.4 
 
 		 362 aa  210  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  41.58 
 
 		 391 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  34.35 
 
 		 403 aa  209  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  35.82 
 
 		 418 aa  209  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  42.18 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  35.64 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  37.33 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  38.2 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  42.18 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  38.94 
 
 		 389 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  36.97 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  36.06 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  39.8 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  38.87 
 
 		 356 aa  195  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  37.5 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  37.7 
 
 		 364 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  35.1 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  40.07 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  37.19 
 
 		 359 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  39.27 
 
 		 374 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  37.19 
 
 		 359 aa  192  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  36.25 
 
 		 395 aa  192  9e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  39.52 
 
 		 369 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  35.34 
 
 		 360 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  39.79 
 
 		 340 aa  189  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  33.51 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  38.16 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  42.8 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  46.3 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  39.93 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  36.6 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  37.8 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  36.21 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  34.25 
 
 		 365 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  36.02 
 
 		 365 aa  186  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  34.25 
 
 		 365 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  33.54 
 
 		 369 aa  185  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  35.87 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  39.79 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  39.79 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  36.54 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  35.62 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  38.79 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  39.79 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  38.61 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  39.08 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  47.09 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.03 
 
 		 359 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  38.73 
 
 		 338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 		 375 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  38.83 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.04 
 
 		 365 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  39.62 
 
 		 405 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  38.38 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  38.38 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  33.88 
 
 		 394 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  37.1 
 
 		 371 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  37.06 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  36.02 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  39.93 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  38.08 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>