More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3916 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 378 aa  724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  56.53 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  58.97 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  60.05 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  55.31 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  58.42 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  58.38 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  59.5 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  57.03 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  57.55 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  53.17 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  54.35 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  53.83 
 
 		 393 aa  359  5e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  57.34 
 
 		 378 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  54.82 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  56.99 
 
 		 378 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  54.2 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  55.68 
 
 		 378 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  55.72 
 
 		 403 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  52.67 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  56.27 
 
 		 391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  54.71 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  54.55 
 
 		 372 aa  331  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  46.62 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  53.41 
 
 		 374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  44.94 
 
 		 396 aa  312  5.999999999999999e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  46.86 
 
 		 422 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  55.52 
 
 		 592 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  48.77 
 
 		 360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 366 aa  285  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  50.54 
 
 		 373 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  46.54 
 
 		 375 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  44.71 
 
 		 387 aa  272  8.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  36.83 
 
 		 374 aa  263  4e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  47.83 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  37.37 
 
 		 375 aa  259  4e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  46.96 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  48.6 
 
 		 369 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  44.23 
 
 		 382 aa  242  7e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  44.77 
 
 		 395 aa  239  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  48.9 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  37.64 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  48.63 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  42.98 
 
 		 371 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  36.73 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  41.71 
 
 		 366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  41.69 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  39.94 
 
 		 389 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  40.51 
 
 		 358 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  40.33 
 
 		 377 aa  212  9e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  40.5 
 
 		 365 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  40.5 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  46.85 
 
 		 366 aa  210  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  40.11 
 
 		 364 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  41.67 
 
 		 379 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  43.02 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  40.23 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  40.23 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  40.62 
 
 		 389 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  37.94 
 
 		 377 aa  206  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  37.18 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  35.62 
 
 		 409 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  40.44 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  44.63 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  44.52 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  40.55 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.33 
 
 		 364 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  42.02 
 
 		 336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  39.79 
 
 		 374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  43.68 
 
 		 371 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  39.79 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  41.39 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  39.28 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  41.13 
 
 		 365 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.7 
 
 		 369 aa  195  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  41.36 
 
 		 387 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  42.7 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  40.56 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  39.66 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  43.84 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  40.33 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  40.11 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  33.52 
 
 		 364 aa  192  7e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  34.08 
 
 		 362 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  39.53 
 
 		 373 aa  192  8e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  38.78 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  35.03 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  42.42 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  38.28 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  38.72 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  39.36 
 
 		 401 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  37.14 
 
 		 365 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  36.68 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  37.56 
 
 		 448 aa  189  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  38.62 
 
 		 475 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>