More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0474 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 403 aa  773    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  70.97 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  70.47 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  68.64 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  65.09 
 
 		 391 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  64.52 
 
 		 391 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  54.32 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  52.2 
 
 		 378 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  53.33 
 
 		 422 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  53.35 
 
 		 372 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  49.88 
 
 		 429 aa  355  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  51.97 
 
 		 422 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  53.2 
 
 		 372 aa  352  7e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  52.35 
 
 		 378 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  55.72 
 
 		 378 aa  349  6e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  53.23 
 
 		 372 aa  345  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  48.28 
 
 		 388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  48.88 
 
 		 383 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  49.75 
 
 		 393 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  49.26 
 
 		 393 aa  326  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  46.15 
 
 		 383 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  44.69 
 
 		 396 aa  316  4e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  48.52 
 
 		 380 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  48.63 
 
 		 380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  49.75 
 
 		 378 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  46.5 
 
 		 387 aa  292  6e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  45.52 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  44.94 
 
 		 374 aa  272  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  50.99 
 
 		 592 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  45.25 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  45.41 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  47.14 
 
 		 402 aa  257  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  46.8 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  42.68 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  42.72 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  46.59 
 
 		 418 aa  242  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  35.06 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  49 
 
 		 372 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  34.32 
 
 		 375 aa  237  2e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  45.96 
 
 		 369 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  48.5 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  49.45 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  41.9 
 
 		 395 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  39.9 
 
 		 364 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  34.58 
 
 		 378 aa  219  8.999999999999998e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.38 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  41.18 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  44.44 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  44.76 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  37.44 
 
 		 377 aa  206  8e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  46.81 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  38.27 
 
 		 366 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  45.96 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  45.39 
 
 		 365 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  39.69 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  42.81 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  34.35 
 
 		 362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  44.84 
 
 		 372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  45.39 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  40.1 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  38.54 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  37.76 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  37.76 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  44.33 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  43.36 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  37.44 
 
 		 421 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  45.55 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  33.58 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  37.37 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  45.16 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  36.43 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  38.29 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  37.69 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  39.13 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  39.29 
 
 		 408 aa  190  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  36.15 
 
 		 369 aa  189  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 379 aa  189  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  45.39 
 
 		 365 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  40.56 
 
 		 389 aa  189  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  36.8 
 
 		 389 aa  189  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  42.81 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  41.73 
 
 		 377 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  40.56 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  40.91 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  54.95 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  45.04 
 
 		 336 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  44.73 
 
 		 373 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  51.14 
 
 		 362 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  40.43 
 
 		 374 aa  186  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  36.7 
 
 		 368 aa  186  8e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  44.44 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  42.66 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  37.06 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  40.65 
 
 		 362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  36.59 
 
 		 308 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  32.64 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  49.04 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  38.81 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>