More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0212 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  100 
 
 
386 aa  770    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  49.59 
 
 
359 aa  323  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  45.36 
 
 
370 aa  299  6e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  48.22 
 
 
358 aa  295  9e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  46.96 
 
 
359 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  48.48 
 
 
356 aa  293  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  46.56 
 
 
364 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  46.72 
 
 
389 aa  292  8e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  46.56 
 
 
366 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  45.86 
 
 
359 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  46.26 
 
 
361 aa  286  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  45.75 
 
 
371 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 
365 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  42.47 
 
 
374 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  41.26 
 
 
364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  44.65 
 
 
394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  41.16 
 
 
362 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  44.78 
 
 
366 aa  249  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  41.69 
 
 
399 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  42.63 
 
 
388 aa  247  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  42.47 
 
 
372 aa  246  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 
367 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  42.36 
 
 
385 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  44.23 
 
 
360 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  40.77 
 
 
369 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.98 
 
 
365 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 
409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  44.05 
 
 
375 aa  240  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  44.17 
 
 
385 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  40.05 
 
 
395 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  42.59 
 
 
374 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.13 
 
 
362 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  36.16 
 
 
369 aa  236  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  48.95 
 
 
668 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  39.76 
 
 
425 aa  235  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  47.1 
 
 
320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  44.44 
 
 
358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  41.95 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  42.07 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  44.03 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  46.64 
 
 
421 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  44.22 
 
 
373 aa  233  6e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  45.67 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  40.88 
 
 
369 aa  232  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  41.4 
 
 
365 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  41.4 
 
 
365 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  42.18 
 
 
366 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  43.79 
 
 
406 aa  231  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 
389 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  43.65 
 
 
373 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  42.02 
 
 
399 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  41.07 
 
 
365 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  42.5 
 
 
365 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  42.51 
 
 
379 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  41.51 
 
 
387 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  43.51 
 
 
368 aa  227  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  38.44 
 
 
361 aa  225  9e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  43.13 
 
 
375 aa  225  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  38.72 
 
 
361 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  41.44 
 
 
364 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  40.71 
 
 
422 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  39.94 
 
 
377 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  37.04 
 
 
363 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  46.45 
 
 
448 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  48.1 
 
 
366 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  42.96 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  40.81 
 
 
379 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  40.11 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  40.05 
 
 
368 aa  220  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  41.07 
 
 
365 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  42.51 
 
 
372 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  38.4 
 
 
381 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  44.48 
 
 
338 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  39.73 
 
 
358 aa  219  7e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  41.59 
 
 
434 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  37.44 
 
 
383 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  44.15 
 
 
338 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  40.47 
 
 
392 aa  218  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  41.59 
 
 
434 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 
405 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  39.57 
 
 
368 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  37.87 
 
 
375 aa  217  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  43.42 
 
 
338 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  46.6 
 
 
365 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.46 
 
 
369 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  40.66 
 
 
377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  39 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  41.78 
 
 
368 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  40.76 
 
 
405 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  39.5 
 
 
408 aa  216  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  40.81 
 
 
371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  47.49 
 
 
433 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  45.45 
 
 
338 aa  215  9e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  38.93 
 
 
383 aa  215  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  41.34 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  45.58 
 
 
422 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  42.38 
 
 
338 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  39.68 
 
 
382 aa  212  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  41.29 
 
 
394 aa  212  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  37.99 
 
 
402 aa  212  9e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>