More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0018 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 442 aa  920    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  40.12 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  39.76 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  48.05 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  45.11 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  39.69 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  45.83 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  47.77 
 
 		 377 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  46.91 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  37.17 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  48.47 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  48.64 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  36.23 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  32.48 
 
 		 362 aa  202  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  47.06 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  36.01 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  36.01 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  46.81 
 
 		 365 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  38.87 
 
 		 366 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  43.7 
 
 		 379 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.03 
 
 		 362 aa  201  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  47.95 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  44.09 
 
 		 336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2463  DNA processing protein DprA, putative  35.69 
 
 		 407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  47.95 
 
 		 365 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  47.73 
 
 		 362 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  36.44 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  32.95 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  45.33 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  39.81 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  45.53 
 
 		 365 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  45.99 
 
 		 372 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  45.61 
 
 		 331 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2135  DNA processing protein  35.21 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  38.36 
 
 		 364 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  35.99 
 
 		 374 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  35.99 
 
 		 374 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  35.99 
 
 		 374 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  37.39 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  45.9 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  47.69 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  46.09 
 
 		 339 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  35.99 
 
 		 374 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  46.96 
 
 		 308 aa  196  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03136  hypothetical protein  36.12 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0428  DNA protecting protein DprA  36.12 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0428  DNA protecting protein DprA  36.12 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0030328  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3788  DNA protecting protein DprA  48.21 
 
 		 373 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00493314  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  36.12 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  45.58 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  42.17 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  46.31 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3479  DNA protecting protein DprA  36.12 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000661668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3581  DNA protecting protein DprA  36.12 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315496  normal  0.18869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  45.89 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  45.12 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  37.2 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  35.71 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  45.45 
 
 		 338 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3670  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 		 374 aa  193  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.206561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3768  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 		 374 aa  193  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00137702  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2377  DNA protecting protein DprA  33.52 
 
 		 421 aa  192  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  35.62 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  45.02 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  45.02 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  47.52 
 
 		 374 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  35.58 
 
 		 374 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  44.04 
 
 		 383 aa  190  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  45.42 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  45.42 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  37.54 
 
 		 389 aa  190  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  46.45 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  46.64 
 
 		 401 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  42.67 
 
 		 369 aa  189  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  47.47 
 
 		 356 aa  189  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  43.67 
 
 		 339 aa  189  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  34.5 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  31.34 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  47.06 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  36.66 
 
 		 397 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  39.6 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  46.79 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  45.25 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  43.84 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.08 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  36.66 
 
 		 397 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  47.6 
 
 		 366 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  35.96 
 
 		 338 aa  187  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  45.25 
 
 		 361 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  33.1 
 
 		 369 aa  186  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  43.72 
 
 		 377 aa  186  8e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  35.63 
 
 		 379 aa  186  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  35.67 
 
 		 338 aa  186  9e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  33.11 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  41.28 
 
 		 401 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  43.46 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  44.13 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  45.02 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>