More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2135 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2135  DNA processing protein  100 
 
 		 405 aa  830    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2463  DNA processing protein DprA, putative  84.48 
 
 		 407 aa  706    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2377  DNA protecting protein DprA  53.32 
 
 		 421 aa  431  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  34.92 
 
 		 384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  37.77 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  37.59 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  37.59 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  42.71 
 
 		 365 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  36.15 
 
 		 365 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3587  DNA protecting protein DprA  35.77 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  40.13 
 
 		 311 aa  210  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  39.48 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  37.04 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  38.61 
 
 		 366 aa  206  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  35.03 
 
 		 377 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  42.7 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  35.71 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  38.8 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  36.64 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  34.26 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  36.68 
 
 		 379 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  34.42 
 
 		 388 aa  201  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  31.72 
 
 		 442 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  41.24 
 
 		 364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.2 
 
 		 362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  38.05 
 
 		 336 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  35.21 
 
 		 442 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  35.14 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  33.75 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  38.31 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  37.58 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  37.3 
 
 		 389 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  42.29 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  34.8 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  34.8 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  35.11 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  33.97 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  34.73 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  35.11 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  35.11 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  35.05 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  35.41 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  35.05 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  34.37 
 
 		 340 aa  190  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  46.01 
 
 		 362 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  34.24 
 
 		 369 aa  189  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  42.03 
 
 		 372 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  36.76 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  40.51 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  40.51 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  34.78 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  36.01 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.13 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  36.01 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  35.33 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  34.48 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  32.37 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  36.09 
 
 		 366 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  32.75 
 
 		 372 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  44.08 
 
 		 368 aa  187  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  35.29 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 296 aa  186  6e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  47.27 
 
 		 308 aa  186  7e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  43.16 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  35.37 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  36.05 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  31.76 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  33.98 
 
 		 373 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  33.62 
 
 		 362 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  34.48 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  41.94 
 
 		 339 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  32.68 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  36.27 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  34.58 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  32.17 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  36.71 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  36.45 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  32.32 
 
 		 389 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  35.93 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  33.16 
 
 		 374 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  32.98 
 
 		 409 aa  179  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03136  hypothetical protein  34.17 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0428  DNA protecting protein DprA  34.17 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  33.24 
 
 		 366 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  34.17 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  35.64 
 
 		 373 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0428  DNA protecting protein DprA  34.17 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0030328  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3479  DNA protecting protein DprA  34.17 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000661668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  35.49 
 
 		 356 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.18 
 
 		 369 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  31.71 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  37.12 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  32.89 
 
 		 374 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  31.93 
 
 		 360 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  34.91 
 
 		 338 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  35.57 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  36.56 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  34.97 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>