More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2463 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_2135  DNA processing protein  84.48 
 
 
405 aa  706    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2463  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 
407 aa  837    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2377  DNA protecting protein DprA  53.32 
 
 
421 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  36.91 
 
 
384 aa  223  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  40.07 
 
 
366 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  41.53 
 
 
311 aa  212  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  36.88 
 
 
381 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  37.87 
 
 
381 aa  211  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  41.46 
 
 
377 aa  210  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  42.81 
 
 
365 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  36.65 
 
 
365 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 
365 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  50.23 
 
 
368 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 
352 aa  206  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  34.7 
 
 
399 aa  206  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  36.34 
 
 
379 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  36.88 
 
 
383 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  41.26 
 
 
364 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3587  DNA protecting protein DprA  35.51 
 
 
375 aa  202  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  42.7 
 
 
365 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  42.86 
 
 
394 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  39.71 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  35.01 
 
 
379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  35.69 
 
 
442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.65 
 
 
362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  39.67 
 
 
375 aa  199  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  40.06 
 
 
366 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  35.69 
 
 
369 aa  196  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  34.84 
 
 
388 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.93 
 
 
369 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  45.06 
 
 
362 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  36.79 
 
 
365 aa  192  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  37.64 
 
 
339 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  34.71 
 
 
374 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  35.08 
 
 
331 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  45.5 
 
 
368 aa  189  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  33.54 
 
 
368 aa  189  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  36.75 
 
 
442 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  46.78 
 
 
308 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  43.22 
 
 
372 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  46.78 
 
 
296 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  34.12 
 
 
338 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  36.56 
 
 
389 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  35 
 
 
338 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  34.41 
 
 
338 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  33.82 
 
 
338 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  34.12 
 
 
338 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  35 
 
 
338 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  34.12 
 
 
338 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  33.15 
 
 
369 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  35.29 
 
 
338 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  34.25 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  35.91 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  35.8 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  34.11 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  34.41 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  32.25 
 
 
409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  40.26 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  37.54 
 
 
421 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  34.45 
 
 
374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  34.8 
 
 
366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  40.85 
 
 
337 aa  182  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  34.24 
 
 
375 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  40.85 
 
 
337 aa  182  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  32.67 
 
 
370 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  35.93 
 
 
368 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  33.98 
 
 
361 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  36.01 
 
 
422 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  34.44 
 
 
373 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  34.48 
 
 
369 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  38.91 
 
 
369 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  39.14 
 
 
408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  36.21 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  40.15 
 
 
365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  40.15 
 
 
365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  33.83 
 
 
359 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  31.72 
 
 
362 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  35.52 
 
 
356 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  37.38 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  37.81 
 
 
401 aa  179  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  42.31 
 
 
339 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  43.67 
 
 
402 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  42.08 
 
 
401 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  36.63 
 
 
364 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  38.2 
 
 
365 aa  179  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  42.08 
 
 
402 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  34.83 
 
 
373 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  34.83 
 
 
373 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  35.86 
 
 
395 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  36.22 
 
 
358 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  36.6 
 
 
371 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  38.18 
 
 
365 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  39.05 
 
 
368 aa  176  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  37.17 
 
 
371 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  33.42 
 
 
366 aa  176  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  37.58 
 
 
320 aa  176  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  35.01 
 
 
362 aa  176  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  38.89 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 
422 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>