More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2865 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 
371 aa  726    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  43.81 
 
 
352 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  50.5 
 
 
365 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  51.57 
 
 
368 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  40.98 
 
 
369 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  41.42 
 
 
379 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  40.16 
 
 
361 aa  245  8e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  44.55 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  52.6 
 
 
366 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  45.39 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  44.08 
 
 
366 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
369 aa  242  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  44.33 
 
 
399 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  49.16 
 
 
365 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  49.16 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  43.22 
 
 
362 aa  239  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  49.5 
 
 
365 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  48.5 
 
 
394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  49.17 
 
 
372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  42.47 
 
 
371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  42.76 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  44.04 
 
 
331 aa  234  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  49.5 
 
 
362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  44.98 
 
 
336 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  39.79 
 
 
373 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  41.69 
 
 
368 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  40.26 
 
 
377 aa  229  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  41.44 
 
 
379 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  45.78 
 
 
339 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  42.77 
 
 
338 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  43.56 
 
 
338 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  43.56 
 
 
338 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  42.47 
 
 
338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  42.47 
 
 
338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  43.56 
 
 
338 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  42.47 
 
 
338 aa  226  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  43.23 
 
 
338 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  43.05 
 
 
365 aa  226  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  40.32 
 
 
373 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  40.32 
 
 
373 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  47.37 
 
 
375 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  46.38 
 
 
373 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  41.91 
 
 
340 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  40.16 
 
 
389 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  45.02 
 
 
308 aa  222  8e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  45.63 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  45.24 
 
 
358 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  42.13 
 
 
364 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  45.02 
 
 
296 aa  219  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  46.6 
 
 
362 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  44.37 
 
 
338 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  40.21 
 
 
377 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3788  DNA protecting protein DprA  40.96 
 
 
373 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00493314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  44.55 
 
 
374 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  42.01 
 
 
365 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  42.01 
 
 
365 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  44.58 
 
 
368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  44.69 
 
 
359 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  42.53 
 
 
377 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  46.13 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  43.68 
 
 
371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  44.34 
 
 
320 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  44.09 
 
 
374 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  45.72 
 
 
311 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  36.34 
 
 
383 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3581  DNA protecting protein DprA  42.06 
 
 
374 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315496  normal  0.18869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  45.98 
 
 
374 aa  209  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  40.59 
 
 
377 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  42.07 
 
 
408 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  43.18 
 
 
339 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  43.81 
 
 
399 aa  209  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03136  hypothetical protein  45.98 
 
 
374 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0428  DNA protecting protein DprA  45.98 
 
 
374 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3670  DNA protecting protein DprA  45.98 
 
 
374 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.206561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3479  DNA protecting protein DprA  45.98 
 
 
374 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000661668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0428  DNA protecting protein DprA  45.98 
 
 
374 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0030328  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  45.98 
 
 
374 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  46.74 
 
 
360 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  45.45 
 
 
374 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  45.45 
 
 
374 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  45.45 
 
 
374 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3768  DNA protecting protein DprA  41.8 
 
 
374 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00137702  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  45.7 
 
 
386 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  44.76 
 
 
388 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  38.16 
 
 
421 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  40.06 
 
 
368 aa  206  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  39.2 
 
 
401 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  45.12 
 
 
374 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  38.61 
 
 
422 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  39.6 
 
 
369 aa  206  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  46.13 
 
 
385 aa  205  8e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  46.69 
 
 
359 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  45.7 
 
 
386 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  45.67 
 
 
372 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  45.12 
 
 
374 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  46.69 
 
 
359 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  45.29 
 
 
356 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  40.8 
 
 
405 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  42.51 
 
 
379 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  44.6 
 
 
366 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>