More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0839 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  100 
 
 		 362 aa  738    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  47.35 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  44.97 
 
 		 370 aa  291  9e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  43.22 
 
 		 366 aa  285  7e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  44.1 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  41.39 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  43.82 
 
 		 371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  41.71 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  41.76 
 
 		 358 aa  265  8e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  42.05 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  40.32 
 
 		 409 aa  263  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  43.48 
 
 		 394 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  41.94 
 
 		 375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  41.79 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  41.35 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  39.89 
 
 		 372 aa  252  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  42.32 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  41.45 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  39.13 
 
 		 386 aa  246  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  41.73 
 
 		 374 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  41.11 
 
 		 364 aa  245  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  40.85 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.07 
 
 		 336 aa  242  9e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  40.49 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  37.43 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  38.68 
 
 		 373 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  40.92 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  38.65 
 
 		 399 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  40.43 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  40.68 
 
 		 385 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  37.37 
 
 		 372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  37.04 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  39.45 
 
 		 389 aa  232  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  37.68 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  37.68 
 
 		 361 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  36.99 
 
 		 365 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  37.36 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  37.36 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  40.55 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  43.49 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  36.96 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  40.21 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  38.55 
 
 		 375 aa  225  8e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  38.62 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  36.01 
 
 		 386 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  34.93 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  33.91 
 
 		 448 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  37.39 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  37.77 
 
 		 384 aa  222  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  34.4 
 
 		 401 aa  222  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  36.71 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  35.95 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  37.57 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  40.66 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  37.43 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  40.19 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  34.96 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  40.4 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  36.29 
 
 		 385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  41.1 
 
 		 362 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  40.06 
 
 		 358 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  37.12 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  35.39 
 
 		 388 aa  219  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  43.53 
 
 		 308 aa  219  7e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  41.81 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  35.11 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  43.53 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  37.36 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  35.32 
 
 		 408 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  45.03 
 
 		 374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  35.29 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  35.03 
 
 		 395 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03136  hypothetical protein  45.71 
 
 		 374 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0428  DNA protecting protein DprA  45.71 
 
 		 374 aa  216  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  45.71 
 
 		 374 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0428  DNA protecting protein DprA  45.71 
 
 		 374 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0030328  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3479  DNA protecting protein DprA  45.71 
 
 		 374 aa  216  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000661668  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  35.61 
 
 		 379 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3581  DNA protecting protein DprA  43.56 
 
 		 374 aa  215  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315496  normal  0.18869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3768  DNA protecting protein DprA  45.36 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00137702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3670  DNA protecting protein DprA  45.36 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.206561  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  35.88 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  38.02 
 
 		 368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  35.52 
 
 		 370 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  45.36 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.27 
 
 		 369 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  45.55 
 
 		 374 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  42.09 
 
 		 373 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  45.2 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.41 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  45.2 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  45.2 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  45.2 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  41.75 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  43.97 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  39.52 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>