More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0703 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 		 402 aa  806    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  51.49 
 
 		 370 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  47.21 
 
 		 372 aa  322  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  46.05 
 
 		 380 aa  315  6e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  48.29 
 
 		 375 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  48.29 
 
 		 375 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  47.34 
 
 		 374 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  38.78 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  37.2 
 
 		 366 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.22 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.52 
 
 		 359 aa  223  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  39.79 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.86 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  38.59 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  34.84 
 
 		 364 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.96 
 
 		 362 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  37.63 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.07 
 
 		 359 aa  212  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  37.99 
 
 		 386 aa  212  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  39.07 
 
 		 359 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  36.44 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  36.39 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  37.94 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  37.32 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  37.95 
 
 		 360 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  35.47 
 
 		 349 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  35.07 
 
 		 356 aa  206  8e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  41.72 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  39.26 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  41.9 
 
 		 362 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  38.44 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  32.97 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.83 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  33.97 
 
 		 364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  32.03 
 
 		 378 aa  199  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  35.28 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 		 368 aa  199  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  39.04 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  35.31 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  36.02 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  35.28 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  37.43 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  37.07 
 
 		 337 aa  192  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  32.54 
 
 		 362 aa  193  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  36.03 
 
 		 392 aa  193  6e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  34.78 
 
 		 374 aa  192  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  36.7 
 
 		 365 aa  192  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  37.67 
 
 		 336 aa  192  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  36.94 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  33.75 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  34.75 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  39.52 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  32.98 
 
 		 363 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  32.01 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  36.73 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  35.11 
 
 		 381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  37.85 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  39.22 
 
 		 370 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  35.92 
 
 		 366 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  33.69 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  36.83 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  37.38 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  36.22 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  37.44 
 
 		 385 aa  187  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  39.19 
 
 		 425 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.04 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  36.46 
 
 		 401 aa  186  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  38.28 
 
 		 358 aa  186  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  41.55 
 
 		 553 aa  186  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  35.7 
 
 		 379 aa  186  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  37.7 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  34.75 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  33.25 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  37.42 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  34.56 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  40.21 
 
 		 668 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  33.08 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  37.91 
 
 		 331 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  36.27 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  36.84 
 
 		 375 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  37.18 
 
 		 402 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  38.59 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  29.19 
 
 		 426 aa  182  9.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  36.9 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  31.51 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  33.88 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  33.65 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  34.34 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  37.75 
 
 		 320 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  36.97 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  34.99 
 
 		 375 aa  180  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  37.68 
 
 		 748 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  37.54 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  34.12 
 
 		 395 aa  179  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  39.41 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2463  DNA processing protein DprA, putative  43.67 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  35.88 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  38.06 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>