More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0771 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 553 aa  1073    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  54.36 
 
 		 668 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  61.54 
 
 		 442 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  58.72 
 
 		 425 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  50.68 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  49.18 
 
 		 367 aa  249  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  40.96 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  46.88 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  42.71 
 
 		 361 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  43.73 
 
 		 386 aa  209  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  45.04 
 
 		 359 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  41.67 
 
 		 361 aa  207  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  38.54 
 
 		 349 aa  207  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  47.02 
 
 		 356 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  45.74 
 
 		 359 aa  206  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  49.56 
 
 		 377 aa  205  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  38.82 
 
 		 352 aa  204  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  44.06 
 
 		 361 aa  204  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  47.06 
 
 		 365 aa  203  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  45.37 
 
 		 370 aa  203  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  45.33 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  56.94 
 
 		 418 aa  202  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  46.62 
 
 		 372 aa  201  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  52.61 
 
 		 320 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  43.92 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  44.84 
 
 		 331 aa  200  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  43.97 
 
 		 359 aa  200  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  42.47 
 
 		 389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  44.72 
 
 		 371 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  44.35 
 
 		 338 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  43.95 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  40.19 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  43.55 
 
 		 338 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  43.55 
 
 		 338 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  46.08 
 
 		 362 aa  196  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  41.59 
 
 		 399 aa  195  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  44.3 
 
 		 338 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  45.73 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  46.44 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  46.24 
 
 		 364 aa  194  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  40.35 
 
 		 368 aa  194  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  43.1 
 
 		 338 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  42.34 
 
 		 340 aa  194  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  44.02 
 
 		 338 aa  193  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  44.02 
 
 		 338 aa  193  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  45.79 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  44.73 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  44.59 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  35.55 
 
 		 365 aa  192  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  50.73 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  45.07 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  41.44 
 
 		 388 aa  192  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  45.91 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  41.46 
 
 		 369 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  44.66 
 
 		 399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  41.97 
 
 		 371 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  43.21 
 
 		 338 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  46.34 
 
 		 405 aa  190  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  45.89 
 
 		 379 aa  190  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.95 
 
 		 362 aa  190  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  41.49 
 
 		 379 aa  190  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  45.25 
 
 		 373 aa  189  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  45.92 
 
 		 401 aa  189  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  40.89 
 
 		 377 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  41.95 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  44.29 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  39.09 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  45.83 
 
 		 383 aa  187  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  43.55 
 
 		 368 aa  187  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  43.81 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  46.19 
 
 		 338 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  43.1 
 
 		 339 aa  187  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  38.3 
 
 		 409 aa  187  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  43.36 
 
 		 279 aa  186  8e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  47.85 
 
 		 336 aa  186  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  42.67 
 
 		 282 aa  186  9e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  43.75 
 
 		 364 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  35.55 
 
 		 356 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  51.71 
 
 		 229 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  33.22 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  53.15 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  41.55 
 
 		 402 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  43.1 
 
 		 360 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  43.14 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  43.94 
 
 		 394 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  35 
 
 		 374 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  42.46 
 
 		 448 aa  183  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  44.69 
 
 		 369 aa  183  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  48 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  43.44 
 
 		 280 aa  182  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  45.49 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  48 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  45.49 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  43.43 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  44.98 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  44.56 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  46.53 
 
 		 362 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  43.21 
 
 		 422 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  50.24 
 
 		 358 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  52.38 
 
 		 365 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>