More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0157 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 372 aa  759    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  35.54 
 
 		 374 aa  216  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  34.24 
 
 		 375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  36.71 
 
 		 358 aa  212  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  37.77 
 
 		 372 aa  206  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.16 
 
 		 409 aa  206  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  36.99 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  36.55 
 
 		 359 aa  202  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  36.55 
 
 		 359 aa  202  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  36.26 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.68 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  37.79 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  35.79 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  35.23 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  36.63 
 
 		 364 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  35.73 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  41.35 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  36.47 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  35.99 
 
 		 375 aa  196  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  38.44 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  37.38 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  36.57 
 
 		 336 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  40.59 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.42 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  32.97 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  34.5 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  38.57 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  35.54 
 
 		 369 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  34.99 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  36 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  36 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  39.13 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  38.41 
 
 		 369 aa  186  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  35.93 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  37.41 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  38.16 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  37.88 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  36.13 
 
 		 360 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  31.73 
 
 		 366 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.42 
 
 		 362 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  33.52 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  32.41 
 
 		 373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  36.3 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  37.07 
 
 		 339 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  34.72 
 
 		 362 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  33.42 
 
 		 374 aa  182  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  33.88 
 
 		 402 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  36.3 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  33.43 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  34.49 
 
 		 364 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  36.01 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  37.02 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  36.71 
 
 		 399 aa  180  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 434 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  35.99 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  31.71 
 
 		 363 aa  179  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  39.43 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3670  DNA protecting protein DprA  36.04 
 
 		 374 aa  179  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.206561  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  34.01 
 
 		 385 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 434 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  43.84 
 
 		 368 aa  179  8e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  33.43 
 
 		 364 aa  179  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03136  hypothetical protein  36.04 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0428  DNA protecting protein DprA  36.04 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0428  DNA protecting protein DprA  36.04 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0030328  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  33.9 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3768  DNA protecting protein DprA  36.04 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00137702  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3581  DNA protecting protein DprA  35.69 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315496  normal  0.18869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  36.04 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  33.96 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  36.04 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3479  DNA protecting protein DprA  36.04 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000661668  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  38.08 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  33.04 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  35.1 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  31.88 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.9 
 
 		 362 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  35.35 
 
 		 373 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  40.68 
 
 		 433 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  40.15 
 
 		 434 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  34.48 
 
 		 368 aa  176  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  36.08 
 
 		 375 aa  175  9e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  38.34 
 
 		 383 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  31.85 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  31.52 
 
 		 748 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  34.41 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  36.49 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  32.72 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  32.95 
 
 		 364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  39.78 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  35.86 
 
 		 389 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  35.49 
 
 		 369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  32.27 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  37.86 
 
 		 448 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  34.69 
 
 		 374 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  34.69 
 
 		 374 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>