More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0995 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 366 aa  745    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03515  Smf protein DNA processing chain A  58.9 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  54.14 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  46.26 
 
 		 363 aa  335  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  40.87 
 
 		 378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  43.09 
 
 		 364 aa  306  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  39.84 
 
 		 374 aa  299  4e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  37.67 
 
 		 370 aa  278  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  39.25 
 
 		 374 aa  262  6e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  34.15 
 
 		 382 aa  199  9e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.05 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  33.33 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  34.35 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  34.07 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  32.09 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  31.77 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  31.35 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  32.76 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  31.2 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  31.62 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  31.05 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  30 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  30.25 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  32.53 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  30.28 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  30.56 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  33.43 
 
 		 367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  32.23 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  30.91 
 
 		 385 aa  179  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  29.78 
 
 		 364 aa  179  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  31.78 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  31.49 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  33.77 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  35.67 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  30.16 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  31.28 
 
 		 383 aa  175  9e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  31.72 
 
 		 362 aa  175  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  30.91 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  35.4 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  33.89 
 
 		 373 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  33.89 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  31.32 
 
 		 369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  33.22 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  33.68 
 
 		 369 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  29.35 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  35.05 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.15 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  35.79 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  29.95 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  30.36 
 
 		 386 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  31.42 
 
 		 368 aa  169  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  31.21 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  28.61 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  37.39 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  27.72 
 
 		 425 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  34.53 
 
 		 365 aa  166  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  30.6 
 
 		 381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  31.16 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  29.86 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  31.49 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  31.61 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  29.62 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  31.49 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  28.23 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  30.68 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  30.46 
 
 		 402 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  31.25 
 
 		 401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  30.11 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  36.6 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  31.3 
 
 		 374 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  33.22 
 
 		 372 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  32.68 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  31.79 
 
 		 379 aa  162  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  33.45 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  29.16 
 
 		 370 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  31.31 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  32.48 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  32.65 
 
 		 364 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  32.77 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  32.88 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  29.27 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  35.13 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  36.44 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  29.27 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  35.13 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  32.15 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  32.41 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  29.97 
 
 		 320 aa  158  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  32.15 
 
 		 338 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  32.15 
 
 		 338 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  28.31 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  34.77 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  41.71 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  34.77 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  30.08 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  34.77 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  34.17 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  40.85 
 
 		 294 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  35.07 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>