More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0778 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 291 aa  592  1e-168  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  43.88 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  42.21 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  49.53 
 
 		 295 aa  211  7.999999999999999e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.12 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  40.86 
 
 		 349 aa  205  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  49.28 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  48.08 
 
 		 279 aa  202  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  48.11 
 
 		 282 aa  195  7e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  42.02 
 
 		 361 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  43.23 
 
 		 361 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  43.58 
 
 		 336 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  45.11 
 
 		 369 aa  189  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  46.23 
 
 		 374 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  38.75 
 
 		 294 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  42.74 
 
 		 352 aa  185  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  39.22 
 
 		 362 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  37.84 
 
 		 399 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 434 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  43.46 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 434 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  44.44 
 
 		 434 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 434 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 434 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  46.7 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  44.44 
 
 		 396 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  44.2 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 396 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  44.5 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  43.33 
 
 		 337 aa  180  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  43.54 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  37.98 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  37.6 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  38.68 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  39.92 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 337 aa  178  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  40.77 
 
 		 358 aa  178  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  43.72 
 
 		 433 aa  178  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  37.37 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  37.98 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  37.21 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  37.21 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  45.97 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  38.27 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  40.69 
 
 		 377 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  39.8 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  44.08 
 
 		 375 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  45.19 
 
 		 361 aa  175  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  37.05 
 
 		 394 aa  175  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  43.93 
 
 		 372 aa  175  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  46.57 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  37.05 
 
 		 374 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  42.72 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  36.99 
 
 		 388 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.38 
 
 		 369 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  43.24 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  41.4 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  35.74 
 
 		 748 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  43.6 
 
 		 375 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  42.42 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  44.06 
 
 		 366 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  40.87 
 
 		 375 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  37.45 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  45.45 
 
 		 401 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  41.46 
 
 		 365 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  43.95 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  34.83 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  37.41 
 
 		 383 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  40.59 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  41.13 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  44.98 
 
 		 402 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  42.11 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  39.05 
 
 		 363 aa  168  9e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  41.95 
 
 		 386 aa  168  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  36.43 
 
 		 442 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  43.06 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  40.85 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  42.72 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  42.65 
 
 		 422 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  43.72 
 
 		 408 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  41.52 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  42.06 
 
 		 422 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  41.07 
 
 		 422 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  42.25 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  41.89 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.46 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  42.06 
 
 		 422 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 386 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  42.33 
 
 		 448 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  42.18 
 
 		 475 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  42.79 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  43.63 
 
 		 553 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  37.62 
 
 		 358 aa  165  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 364 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  35.09 
 
 		 395 aa  165  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  40.55 
 
 		 364 aa  165  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  41.18 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  41.18 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  42.06 
 
 		 418 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>