More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3876 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  100 
 
 		 289 aa  592  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  97.92 
 
 		 289 aa  584  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  96.19 
 
 		 289 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  95.16 
 
 		 289 aa  569  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  94.46 
 
 		 289 aa  567  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  90.31 
 
 		 289 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  89.97 
 
 		 289 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  84.43 
 
 		 289 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  68.51 
 
 		 291 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3685  nucleotide-binding SMF protein  91.59 
 
 		 221 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.455152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  46.48 
 
 		 294 aa  275  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  42.25 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  44.14 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  41.67 
 
 		 362 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.86 
 
 		 362 aa  201  9e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  42.53 
 
 		 374 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  42.28 
 
 		 394 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  44.54 
 
 		 361 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  47.2 
 
 		 282 aa  191  9e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  39.6 
 
 		 406 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.62 
 
 		 356 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  42.48 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  39.2 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  45.93 
 
 		 358 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  43.39 
 
 		 366 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  45.12 
 
 		 333 aa  188  7e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  41.27 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  41.28 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  37.31 
 
 		 409 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  44.81 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  38.16 
 
 		 364 aa  185  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  39.2 
 
 		 373 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  45.5 
 
 		 363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  44.76 
 
 		 374 aa  182  6e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  40.61 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  43.72 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  40.25 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  46.83 
 
 		 365 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  46.83 
 
 		 365 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  45.28 
 
 		 366 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  46.89 
 
 		 369 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  40.23 
 
 		 361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  46.41 
 
 		 368 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  42.36 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  45.16 
 
 		 264 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  45.16 
 
 		 371 aa  178  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  40.59 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  37.98 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  42.31 
 
 		 389 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.68 
 
 		 359 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  43.33 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  36.67 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  41.25 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  44.23 
 
 		 401 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.48 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  37.4 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  46.34 
 
 		 367 aa  175  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  37.59 
 
 		 405 aa  175  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  38.91 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 386 aa  175  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  37.72 
 
 		 369 aa  175  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  35.76 
 
 		 375 aa  174  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  40.73 
 
 		 364 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  41.44 
 
 		 401 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  44.98 
 
 		 418 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  43.93 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  41.02 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  43.56 
 
 		 359 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  45.45 
 
 		 308 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.76 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  44.72 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  38.28 
 
 		 369 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  39.34 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  39.75 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  39.75 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  39.75 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  45 
 
 		 386 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  35.64 
 
 		 365 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  45.54 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  44.19 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0815  DNA processing protein DprA, putative  38.91 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.486528  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  43.44 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  43.54 
 
 		 229 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  43.33 
 
 		 442 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  39.75 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  43.96 
 
 		 362 aa  169  3e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.13 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  33.09 
 
 		 366 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  44.81 
 
 		 425 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  38.68 
 
 		 385 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 372 aa  168  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  44.55 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  40.89 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  42.47 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  37.91 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  45.67 
 
 		 553 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  44.98 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  40.48 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  42.52 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  45.24 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>