More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS3685 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3685  nucleotide-binding SMF protein  100 
 
 
221 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.455152  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  98.13 
 
 
289 aa  434  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  96.73 
 
 
289 aa  427  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  96.26 
 
 
289 aa  427  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  93.93 
 
 
289 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  91.59 
 
 
289 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  86.45 
 
 
289 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  86.45 
 
 
289 aa  384  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  80.84 
 
 
289 aa  367  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  62.62 
 
 
291 aa  287  8e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  39.32 
 
 
294 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  35.92 
 
 
293 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.17 
 
 
409 aa  114  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  34.65 
 
 
382 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1232  SMF family protein  42.25 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.25702  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 
362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  45.31 
 
 
349 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  40.85 
 
 
333 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  41.61 
 
 
356 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  42.07 
 
 
264 aa  106  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  34.73 
 
 
394 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  34.07 
 
 
374 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0815  DNA processing protein DprA, putative  36.76 
 
 
290 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.486528  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  33.33 
 
 
406 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  29.21 
 
 
366 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.91 
 
 
362 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  38.46 
 
 
281 aa  102  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
373 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  30.65 
 
 
356 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  31 
 
 
370 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  30.5 
 
 
291 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  34.03 
 
 
370 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  36.77 
 
 
288 aa  99.8  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  39.39 
 
 
365 aa  99.4  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  39.39 
 
 
365 aa  99.4  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  42.11 
 
 
279 aa  99  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  33.87 
 
 
361 aa  98.2  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  33.52 
 
 
373 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  33.81 
 
 
358 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1396  DNA processing protein DprA, putative  29.5 
 
 
368 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.649924  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  33.33 
 
 
402 aa  97.1  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  33.33 
 
 
361 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  38.67 
 
 
372 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  34.76 
 
 
366 aa  96.3  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  34.15 
 
 
361 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  33.99 
 
 
337 aa  95.9  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  33.99 
 
 
337 aa  94.7  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  29.58 
 
 
375 aa  94.7  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  27.62 
 
 
364 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  40.31 
 
 
401 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  34.18 
 
 
378 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  37.04 
 
 
374 aa  92.8  4e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  30.39 
 
 
375 aa  92.8  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  32.91 
 
 
362 aa  92.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  40.8 
 
 
330 aa  92.4  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  33.56 
 
 
385 aa  92  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  36.81 
 
 
375 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  40.65 
 
 
280 aa  92  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  38.76 
 
 
418 aa  92  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  37.98 
 
 
401 aa  91.7  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  40 
 
 
363 aa  91.7  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  32.24 
 
 
380 aa  91.7  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  39.1 
 
 
366 aa  91.3  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  30.98 
 
 
363 aa  91.7  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  37.97 
 
 
282 aa  91.7  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  32.08 
 
 
295 aa  91.3  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  36.81 
 
 
375 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  34.81 
 
 
375 aa  90.9  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  38.81 
 
 
385 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  37.98 
 
 
402 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  28.18 
 
 
379 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  38.71 
 
 
308 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  30 
 
 
372 aa  90.1  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  29.76 
 
 
320 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  33.73 
 
 
364 aa  89.4  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  26.94 
 
 
360 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  34.04 
 
 
369 aa  89.4  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0031  DNA protecting protein DprA  31.61 
 
 
307 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  38.71 
 
 
296 aa  88.6  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 
371 aa  88.2  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  30.95 
 
 
372 aa  88.2  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  39.23 
 
 
374 aa  88.2  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 
365 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  37.01 
 
 
367 aa  88.2  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  36.03 
 
 
368 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  28.36 
 
 
426 aa  87  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  29.52 
 
 
365 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  34.51 
 
 
364 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  28.31 
 
 
399 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 
339 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  28.49 
 
 
372 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  35.86 
 
 
352 aa  86.3  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  27.49 
 
 
359 aa  85.9  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  33.12 
 
 
389 aa  85.5  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 
364 aa  85.1  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  33.82 
 
 
369 aa  85.1  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  31.68 
 
 
368 aa  85.1  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  35.38 
 
 
442 aa  84.7  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  36.22 
 
 
592 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  29.63 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>