More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0915 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  100 
 
 		 281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  43.88 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  42.96 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  40.65 
 
 		 362 aa  205  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  47.55 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.7 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  47.21 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  47.29 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  46.31 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  44.17 
 
 		 366 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  47.52 
 
 		 280 aa  188  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  43.35 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  43.35 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  48.15 
 
 		 389 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  44.9 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  39.07 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  45.18 
 
 		 293 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  43.35 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  42.86 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  42.86 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  36.86 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  38.57 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  48.69 
 
 		 373 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  42.36 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  42.02 
 
 		 406 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  37.28 
 
 		 374 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  39.3 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  42.36 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  40.25 
 
 		 369 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  44.33 
 
 		 264 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  41.87 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  41.77 
 
 		 373 aa  178  9e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  44.17 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.37 
 
 		 361 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  36.63 
 
 		 377 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  40.72 
 
 		 553 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  41.25 
 
 		 409 aa  175  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  42.13 
 
 		 368 aa  175  8e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  45.36 
 
 		 282 aa  175  8e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  41.01 
 
 		 364 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  33.94 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  37.32 
 
 		 369 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  38.83 
 
 		 385 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.09 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  34.49 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  36 
 
 		 360 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  43.78 
 
 		 352 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  44.02 
 
 		 374 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  34.91 
 
 		 395 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  34.88 
 
 		 356 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  35.52 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.23 
 
 		 399 aa  168  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  44.28 
 
 		 362 aa  168  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  41.33 
 
 		 371 aa  168  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  42.42 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  38.72 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  39.15 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  35.71 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  39.15 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  43.28 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  39.15 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  43.09 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.53 
 
 		 368 aa  166  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  39.15 
 
 		 374 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  38.65 
 
 		 374 aa  166  4e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  42.42 
 
 		 425 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  36.4 
 
 		 377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 384 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  43.07 
 
 		 375 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  35.17 
 
 		 668 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  35.66 
 
 		 373 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  37.36 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  35.66 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  33.96 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  35.88 
 
 		 360 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  41.59 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  35.23 
 
 		 375 aa  163  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  34.64 
 
 		 367 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  38.49 
 
 		 375 aa  163  3e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  37.13 
 
 		 364 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  35.82 
 
 		 401 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  42.34 
 
 		 442 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  36.6 
 
 		 366 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  41.38 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  39.53 
 
 		 433 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  35.4 
 
 		 373 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  42.57 
 
 		 368 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  41.75 
 
 		 365 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  41.75 
 
 		 365 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  37.23 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  37.23 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  37.23 
 
 		 338 aa  161  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  40.38 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.33 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  41.79 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  43.16 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  40.45 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  43.16 
 
 		 374 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.26 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3479  DNA protecting protein DprA  43.16 
 
 		 374 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000661668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>