More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1020 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  100 
 
 		 295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  51.9 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  44.35 
 
 		 349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  49.53 
 
 		 291 aa  211  9e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  47.55 
 
 		 281 aa  205  7e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  43.72 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  43.26 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  44.5 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  38.95 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  45.32 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  43.93 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  41.32 
 
 		 282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  42.5 
 
 		 364 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  38.69 
 
 		 364 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  40.67 
 
 		 356 aa  189  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  44.65 
 
 		 293 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  45.27 
 
 		 371 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  39.51 
 
 		 366 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  43.61 
 
 		 367 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  44.04 
 
 		 373 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.13 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  44.26 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  43.63 
 
 		 360 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  43.96 
 
 		 352 aa  185  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  42.34 
 
 		 360 aa  185  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  41.15 
 
 		 394 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.56 
 
 		 369 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  41.92 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  45.1 
 
 		 406 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  45.28 
 
 		 374 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  42.29 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  39.2 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.95 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  42.66 
 
 		 748 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  40.37 
 
 		 368 aa  178  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  38.49 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  43.66 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  37.76 
 
 		 337 aa  177  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  37.76 
 
 		 337 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  38.49 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  42.65 
 
 		 425 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  43.14 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  41.95 
 
 		 369 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  43.63 
 
 		 373 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  35.08 
 
 		 668 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  39.17 
 
 		 364 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  38.49 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  41.04 
 
 		 409 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  40.48 
 
 		 358 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  40.26 
 
 		 356 aa  175  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  37.92 
 
 		 289 aa  175  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  38.91 
 
 		 289 aa  175  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  38.08 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  41.43 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  40.51 
 
 		 361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  36.8 
 
 		 372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  33.74 
 
 		 395 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 		 369 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  38.01 
 
 		 442 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  37.5 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  38.94 
 
 		 333 aa  172  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  41.43 
 
 		 369 aa  172  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  38.91 
 
 		 365 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  40.6 
 
 		 359 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  40.08 
 
 		 361 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  42.72 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  41.71 
 
 		 381 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  41.71 
 
 		 381 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  40.09 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  39.64 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  39.64 
 
 		 375 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  41.04 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  40.47 
 
 		 388 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  40.48 
 
 		 336 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 553 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  41.71 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  37.78 
 
 		 360 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  40.83 
 
 		 377 aa  168  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  42.65 
 
 		 364 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  43.35 
 
 		 366 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  41.83 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  40.47 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  39.02 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  40.27 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  40.62 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  39.72 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  41.87 
 
 		 433 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  39.45 
 
 		 363 aa  166  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  40.59 
 
 		 368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  40 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  40.76 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  40.76 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  34.25 
 
 		 405 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3587  DNA protecting protein DprA  41.43 
 
 		 375 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  38.24 
 
 		 382 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  40.28 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>