More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0382 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 382 aa  775    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  57.61 
 
 		 382 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  53.62 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  53.62 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  51.86 
 
 		 392 aa  350  3e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  47.92 
 
 		 385 aa  335  7e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  54.35 
 
 		 286 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  40.76 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  39.62 
 
 		 370 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  39.89 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.04 
 
 		 356 aa  243  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.83 
 
 		 358 aa  243  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.04 
 
 		 359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 360 aa  235  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 359 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.5 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  40.96 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  39.44 
 
 		 373 aa  222  9e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  40.06 
 
 		 373 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  35.62 
 
 		 371 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  38.68 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  39.23 
 
 		 406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  37.6 
 
 		 374 aa  219  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  36.22 
 
 		 364 aa  216  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  37.25 
 
 		 366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  35.04 
 
 		 389 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.53 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  38.6 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  37.27 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  35.36 
 
 		 379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  37.29 
 
 		 362 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  37.43 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.19 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  34.53 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  40.99 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  38.27 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  41.28 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  37.23 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  40.98 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.34 
 
 		 365 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  32.47 
 
 		 395 aa  206  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  33.85 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  34.31 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  35.61 
 
 		 360 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  36.39 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  37.62 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  36.59 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  40.4 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  35.53 
 
 		 360 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  38.33 
 
 		 338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  38.44 
 
 		 338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  38 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  36.39 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  35.12 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  35.31 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.48 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  33.42 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  34.67 
 
 		 388 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  35.08 
 
 		 375 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 		 364 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  37.42 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  35.79 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  35.37 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  39.58 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  33.51 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  39.87 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  35.2 
 
 		 369 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  36.01 
 
 		 386 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  38.97 
 
 		 338 aa  192  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 386 aa  192  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  34.33 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  36.68 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  37.21 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  34.83 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  39.93 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  39.65 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  36.68 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  40.14 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  39.12 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  38.67 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  36.12 
 
 		 374 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  36.94 
 
 		 349 aa  189  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  36.19 
 
 		 387 aa  189  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  35.58 
 
 		 393 aa  189  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  36.12 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  37.37 
 
 		 368 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  34.92 
 
 		 372 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  32.89 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  36.12 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  36.12 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  38.81 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  36.28 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  38.33 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>