More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03515 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03515  Smf protein DNA processing chain A  100 
 
 		 366 aa  757    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  58.9 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  56.35 
 
 		 364 aa  429  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  41.48 
 
 		 378 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  43.8 
 
 		 363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  42.11 
 
 		 364 aa  292  6e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  38.59 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  35.95 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  37.78 
 
 		 372 aa  259  7e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  36.93 
 
 		 374 aa  239  8e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  29.64 
 
 		 385 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  32.24 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  30.45 
 
 		 361 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  32.4 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  33.06 
 
 		 409 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  31.98 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  31.81 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  31.83 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  31.75 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  29.89 
 
 		 359 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  29.29 
 
 		 385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  28.81 
 
 		 359 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  31.07 
 
 		 369 aa  162  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  34.59 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  29.05 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  32.6 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  28.57 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  31.1 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  30.62 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  35.62 
 
 		 406 aa  159  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  31.29 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  31.35 
 
 		 374 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  34.26 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  30.77 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  35.33 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  29.36 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  27.93 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  30.64 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  32.33 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  34.93 
 
 		 373 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  28.25 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  33.06 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  33 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  27.78 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  28.93 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  29.62 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  31.04 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  30.87 
 
 		 394 aa  152  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  29.02 
 
 		 369 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  34.46 
 
 		 352 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  30.64 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  33.33 
 
 		 308 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  31.25 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  31.01 
 
 		 553 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  31.21 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  35.47 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  32.23 
 
 		 399 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  30.52 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  33.33 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  33.45 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  32.76 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  29.67 
 
 		 402 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  34.13 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  28.06 
 
 		 388 aa  149  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  29.23 
 
 		 336 aa  149  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  33.22 
 
 		 296 aa  149  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  29.47 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  33.45 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  30.07 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  32.87 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  27.57 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  31.42 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  28.24 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  32.87 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  43.68 
 
 		 330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  28.42 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  27.05 
 
 		 379 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  30.99 
 
 		 363 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  37.72 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  34.31 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 386 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  28.37 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  31.71 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  28.85 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  31.88 
 
 		 373 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  27.94 
 
 		 360 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  31.88 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  28.85 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  28.3 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  37.25 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  27.2 
 
 		 375 aa  143  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  32.33 
 
 		 399 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  36.76 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  30.29 
 
 		 442 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  38.24 
 
 		 338 aa  143  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  35.75 
 
 		 372 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  29.58 
 
 		 338 aa  143  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  31.46 
 
 		 383 aa  142  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  32.85 
 
 		 369 aa  142  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>