More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1987 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  99.73 
 
 		 376 aa  729    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 		 376 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 376 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  64.71 
 
 		 388 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  63.9 
 
 		 379 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  67.66 
 
 		 389 aa  421  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  51.86 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  51.76 
 
 		 374 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  51.88 
 
 		 383 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  46.97 
 
 		 422 aa  268  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.99 
 
 		 396 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  45.62 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  49.32 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  43.25 
 
 		 423 aa  242  7.999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  45.29 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  44.26 
 
 		 452 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  48.56 
 
 		 475 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  46.59 
 
 		 408 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  43.85 
 
 		 394 aa  235  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  42.55 
 
 		 444 aa  233  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  42.14 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  46.13 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  47.6 
 
 		 402 aa  226  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  48.57 
 
 		 446 aa  227  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  47.94 
 
 		 402 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  48.44 
 
 		 600 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  44.63 
 
 		 378 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  52.65 
 
 		 402 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  46.35 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  46.97 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  48.34 
 
 		 400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  41.37 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  42.23 
 
 		 371 aa  203  5e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  48.11 
 
 		 428 aa  192  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  45.02 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  48.05 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  37.35 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  33.13 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 394 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  35.94 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  36.09 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  31.48 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  41.67 
 
 		 361 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  31.48 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  32.43 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  35.09 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  35.16 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  33.65 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  37.82 
 
 		 365 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  35.77 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  34.94 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  42.01 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  34.82 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  44.07 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  37.54 
 
 		 375 aa  149  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  34.82 
 
 		 360 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  29.78 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  35.85 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  33.98 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  40 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  38.95 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  38.95 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  35.11 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.47 
 
 		 370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.01 
 
 		 362 aa  146  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  32.17 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  36.42 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03515  Smf protein DNA processing chain A  29.33 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  39.23 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  39.82 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  31.89 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  35.89 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  39.27 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  34.67 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  35.47 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  31.89 
 
 		 748 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  40.17 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  43.82 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  31.37 
 
 		 514 aa  143  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  36.84 
 
 		 295 aa  143  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  35.08 
 
 		 406 aa  143  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  35.67 
 
 		 361 aa  142  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  35.4 
 
 		 364 aa  143  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 363 aa  142  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  35.88 
 
 		 370 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  31.61 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  43 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  32.1 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  36.76 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  34.08 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3587  DNA protecting protein DprA  41.28 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  40.48 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  35.2 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  30.8 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  34.21 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  34.45 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  36.04 
 
 		 389 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>