More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1643 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 388 aa  754    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  51.19 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  52.34 
 
 		 374 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  52.13 
 
 		 376 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  51.86 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  51.86 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  51.84 
 
 		 379 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  49.87 
 
 		 389 aa  288  8e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  45.66 
 
 		 422 aa  259  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  43.38 
 
 		 423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  43.73 
 
 		 402 aa  236  7e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 444 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  43.26 
 
 		 387 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.69 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  43.57 
 
 		 391 aa  219  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  40.79 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  45.05 
 
 		 452 aa  215  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  44.94 
 
 		 384 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  43.08 
 
 		 475 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  44.65 
 
 		 408 aa  209  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  44.3 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  45.15 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  44.22 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  41.69 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  42.6 
 
 		 600 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  41.5 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  47.01 
 
 		 395 aa  193  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  41.93 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  42.43 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  41.36 
 
 		 446 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  47.22 
 
 		 371 aa  185  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  43.77 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  40.16 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  37.72 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  42 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  33.42 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  40.8 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  41.86 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  36.33 
 
 		 365 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  37.35 
 
 		 368 aa  155  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 428 aa  152  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  39.43 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  36.96 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.84 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  31.38 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  37.4 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  34.05 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  38.16 
 
 		 339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  37.6 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  35.08 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  42.31 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.06 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  42.64 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  37.94 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  45.36 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  31.37 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  32.84 
 
 		 363 aa  146  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  36.6 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  39.46 
 
 		 385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  44.1 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  38.53 
 
 		 336 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 		 367 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  38.93 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  33.77 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.89 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 377 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.21 
 
 		 362 aa  143  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  38.1 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  46.43 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  46.43 
 
 		 381 aa  142  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  37.07 
 
 		 360 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  37.46 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  28.91 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  34.08 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  34.82 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  35.32 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  27.88 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  32.05 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  36.51 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  36.03 
 
 		 748 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  34.78 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  35.9 
 
 		 383 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  38.43 
 
 		 375 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  45.41 
 
 		 374 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  35.16 
 
 		 337 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  36.71 
 
 		 364 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  38.69 
 
 		 514 aa  139  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 		 434 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  38.3 
 
 		 377 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  39.66 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  44.5 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  37.26 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>