More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6742 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6742  SMF family protein  100 
 
 		 302 aa  579  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0382369  normal  0.0640366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6741  putative DNA processing smf-family protein  50.55 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000806567  normal  0.0643644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  41.28 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6740  SMF family protein  41.81 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00228077  normal  0.067475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  37.63 
 
 		 446 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  39.27 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  38.82 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  39.13 
 
 		 408 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  37.4 
 
 		 394 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  36.08 
 
 		 423 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  40.61 
 
 		 475 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  39 
 
 		 394 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  39.55 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  34.32 
 
 		 387 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  37.39 
 
 		 600 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  36.61 
 
 		 402 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  38.68 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  32.41 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  38.43 
 
 		 383 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  36.4 
 
 		 384 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  36.89 
 
 		 378 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  33.76 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  37.13 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  37.71 
 
 		 428 aa  99.8  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  37.34 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  32.61 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  38.16 
 
 		 395 aa  93.6  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  35.43 
 
 		 424 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  34.75 
 
 		 361 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  32.5 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  34.68 
 
 		 425 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.62 
 
 		 396 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  25.38 
 
 		 349 aa  89  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  29.91 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.28 
 
 		 369 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  35.65 
 
 		 379 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  35.4 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  36.24 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  35.98 
 
 		 452 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  31.56 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  32.49 
 
 		 339 aa  86.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  34.51 
 
 		 418 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  35.65 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  31.86 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  36.28 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  31 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  35.42 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  31.5 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  34.2 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  27.83 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  30.47 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  32.11 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  27.56 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  32.87 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  29.52 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  27.69 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  29.52 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  35.98 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  29.77 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  36.9 
 
 		 668 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  29.05 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  34.08 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  31.9 
 
 		 375 aa  79.3  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  36.4 
 
 		 376 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  36.4 
 
 		 376 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  36.4 
 
 		 376 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  27.78 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  32.06 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  35.43 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  33.89 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  34.8 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  30.85 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  27.09 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  32.75 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  26.83 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  33.48 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  32.56 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  29.54 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  30.33 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  32.72 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0475  Smf family DNA processing protein  31.53 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.966242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  34.33 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  30.6 
 
 		 380 aa  75.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  34.23 
 
 		 386 aa  75.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  29.83 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  32.34 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  27.75 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  32.56 
 
 		 553 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  25.93 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  30.83 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  29.19 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  33.16 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  28.88 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  32.43 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  29.44 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  29.2 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  29.05 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  29.6 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  25.93 
 
 		 360 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>