More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4288 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4288  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 288 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.620065  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2616  tRNA pseudouridine synthase A  74.9 
 
 		 296 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0595  tRNA pseudouridine synthase A  66.44 
 
 		 294 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5154  tRNA pseudouridine synthase A  66.91 
 
 		 279 aa  344  8.999999999999999e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3109  tRNA pseudouridine synthase A  67.62 
 
 		 286 aa  335  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0966  tRNA pseudouridine synthase A  62.18 
 
 		 284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.982634  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1219  tRNA pseudouridine synthase A  59.22 
 
 		 300 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0336  tRNA pseudouridine synthase A  64.12 
 
 		 297 aa  297  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0521282  decreased coverage  0.000493402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0612  tRNA pseudouridine synthase A  63.06 
 
 		 274 aa  290  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3871  tRNA pseudouridine synthase A  59.7 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0658  tRNA pseudouridine synthase A  56.49 
 
 		 293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3380  tRNA pseudouridine synthase A  58.48 
 
 		 273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2620  tRNA pseudouridine synthase A  58.54 
 
 		 306 aa  280  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04290  pseudouridylate synthase I  57.44 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29400  pseudouridylate synthase I  57.41 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6020  tRNA pseudouridine synthase A  62.69 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0748411  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6581  tRNA-pseudouridine synthase I  61.42 
 
 		 314 aa  275  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.22035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4476  tRNA pseudouridine synthase A  60.22 
 
 		 282 aa  275  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4284  tRNA pseudouridine synthase A  56.83 
 
 		 276 aa  269  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143987  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3667  tRNA pseudouridine synthase A  54.29 
 
 		 291 aa  266  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3893  tRNA-pseudouridine synthase I  57.92 
 
 		 276 aa  265  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1120  tRNA-pseudouridine synthase I  71.13 
 
 		 360 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23260  pseudouridylate synthase I  55.4 
 
 		 346 aa  262  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20550  pseudouridylate synthase I  53.21 
 
 		 297 aa  256  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.703936  normal  0.499894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0717  tRNA-pseudouridine synthase I  64.38 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1144  tRNA pseudouridine synthase A  54.39 
 
 		 299 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13492  tRNA pseudouridine synthase A  54.06 
 
 		 297 aa  254  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.39431  normal  0.20778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1115  tRNA pseudouridine synthase A  54.04 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1132  tRNA pseudouridine synthase A  54.04 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2653  tRNA pseudouridine synthase A  52.16 
 
 		 297 aa  252  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1174  tRNA pseudouridine synthase A  56.89 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.329599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4968  tRNA pseudouridine synthase A  53.33 
 
 		 298 aa  237  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803704  normal  0.567804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2938  tRNA pseudouridine synthase A  49.12 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0615  tRNA pseudouridine synthase A  49.82 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16880  pseudouridylate synthase I  50.52 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1735  pseudouridylate synthase  45.72 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1438  tRNA pseudouridine synthase A  52.69 
 
 		 299 aa  224  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0280  tRNA pseudouridine synthase A  43.29 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  45.1 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1129  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21360  pseudouridylate synthase I  42.64 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0418388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  34.62 
 
 		 256 aa  155  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  43.25 
 
 		 259 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1744  tRNA pseudouridine synthase A  38.46 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  39.62 
 
 		 271 aa  152  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  37.88 
 
 		 261 aa  152  8e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  37.88 
 
 		 261 aa  152  8e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  42.52 
 
 		 262 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1051  tRNA pseudouridine synthase A  40.94 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000873816  hitchhiker  0.00519599 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  36.26 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  39.93 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  37.78 
 
 		 270 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  39.69 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  36.29 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  35.69 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  35.69 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1251  tRNA pseudouridine synthase A  38.76 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124214  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2123  tRNA pseudouridine synthase A  40.78 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.521479  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1018  pseudouridylate synthase  37.7 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  39.84 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1368  tRNA pseudouridine synthase A  43.92 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  33.72 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2502  tRNA pseudouridine synthase A  36.51 
 
 		 248 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419434  normal  0.63805 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  32.17 
 
 		 252 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1896  tRNA pseudouridine synthase A  36.5 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  41.83 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  38.81 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2717  tRNA pseudouridine synthase A  37.73 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0374382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0483  tRNA pseudouridine synthase A  35.32 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1729  tRNA pseudouridine synthase A  40.7 
 
 		 271 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992895  hitchhiker  0.00555362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2071  tRNA pseudouridine synthase A  40.7 
 
 		 271 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.179151  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  36.19 
 
 		 255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1560  tRNA pseudouridine synthase A  39.53 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.949883  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1321  tRNA pseudouridine synthase A  35.04 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  38.08 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  40.78 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  32.17 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  41.11 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3817  tRNA pseudouridine synthase A  37.55 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  34.82 
 
 		 246 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  32.17 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  33.07 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  40.23 
 
 		 270 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3148  tRNA pseudouridine synthase A  41.18 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733437  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  39.06 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  41.76 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  39.06 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  35.69 
 
 		 262 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1662  tRNA pseudouridine synthase A  36.78 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.192563  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  40.39 
 
 		 245 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  32.17 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  32.67 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  32.67 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1266  tRNA pseudouridine synthase A  35.69 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  39.22 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  32.67 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  39.22 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  39.22 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  39.22 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>