More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0410 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 245 aa  493  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  97.96 
 
 		 245 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  95.51 
 
 		 264 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4191  tRNA pseudouridine synthase A  80.82 
 
 		 245 aa  397  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  51.02 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  48.57 
 
 		 244 aa  238  9e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  50.2 
 
 		 244 aa  234  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  52.24 
 
 		 252 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  48.18 
 
 		 262 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  45.53 
 
 		 250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  45.53 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  49.38 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  46.94 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000753277  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  48.56 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  43.21 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  43.21 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  43.8 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  46.37 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  39.59 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1258  tRNA pseudouridine synthase A  43.39 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  43.72 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  43.62 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  44.03 
 
 		 261 aa  191  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  46.91 
 
 		 271 aa  191  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1234  tRNA pseudouridine synthase A  47.3 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.512181  normal  0.233712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  47.54 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2159  tRNA pseudouridine synthase A  44.3 
 
 		 260 aa  190  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0844535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  43.8 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  42.28 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  43.09 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  42.28 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  42.68 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  42.68 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  42.8 
 
 		 270 aa  188  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  42.8 
 
 		 270 aa  188  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  42.8 
 
 		 270 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  42.8 
 
 		 270 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  42.8 
 
 		 270 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  38.62 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  43.21 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1465  tRNA pseudouridine synthase A  44.21 
 
 		 283 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2306  tRNA pseudouridine synthase A  44.21 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0438465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1914  tRNA pseudouridine synthase A  43.39 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  40 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  44.76 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  44.44 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  41.46 
 
 		 270 aa  185  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  42.39 
 
 		 270 aa  185  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  44.18 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2742  tRNA pseudouridine synthase A  44.03 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0368715  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03101  tRNA pseudouridine synthase A  43.21 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3614  tRNA pseudouridine synthase A  40.42 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421656  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  44.18 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  44.03 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  43.5 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  43.62 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1617  tRNA pseudouridine synthase A  44.03 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  41.98 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0364  tRNA pseudouridine synthase A  42.39 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  44.03 
 
 		 270 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4624  tRNA pseudouridine synthase A  44.03 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.886734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  43.62 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  43.21 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  43.21 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  43.21 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  43.78 
 
 		 274 aa  181  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  43.21 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  44.35 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  43.62 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3572  tRNA pseudouridine synthase A  43.21 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00438278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4411  tRNA pseudouridine synthase A  43.21 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3956  tRNA pseudouridine synthase A  43.21 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0536594  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  40.56 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  40.56 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  41.32 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  41.08 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3851  tRNA pseudouridine synthase A  43.21 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1560  tRNA pseudouridine synthase A  42.39 
 
 		 302 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.949883  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1259  tRNA pseudouridine synthase A  44.12 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  40.73 
 
 		 247 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  40.25 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2127  tRNA pseudouridine synthase A  42.8 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00123964 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2696  tRNA pseudouridine synthase A  42.51 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23840  tRNA pseudouridine synthase A  44.67 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866913  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1338  tRNA pseudouridine synthase A  42.68 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556339  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0504  tRNA pseudouridine synthase A  43.8 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00170943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2800  tRNA pseudouridine synthase A  44.63 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2556  tRNA pseudouridine synthase A  42.68 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2510  tRNA pseudouridine synthase A  42.68 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1896  tRNA pseudouridine synthase A  42.62 
 
 		 274 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2610  tRNA pseudouridine synthase A  42.68 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  0.0539335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2598  tRNA pseudouridine synthase A  42.68 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.814522  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2719  tRNA pseudouridine synthase A  42.68 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.152064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2474  tRNA pseudouridine synthase A  42.68 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3458  tRNA pseudouridine synthase A  42.68 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3346  tRNA pseudouridine synthase A  42.8 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.291019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1334  tRNA pseudouridine synthase A  42.68 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>