More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1051 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1051  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 255 aa  530  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000873816  hitchhiker  0.00519599 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21360  pseudouridylate synthase I  59.61 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0418388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12020  pseudouridylate synthase I  58.66 
 
 		 273 aa  285  4e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1129  tRNA pseudouridine synthase A  55.38 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  38.65 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  44.14 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.8 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  35.91 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  39.44 
 
 		 245 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  35.91 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.25 
 
 		 246 aa  168  9e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  36.76 
 
 		 252 aa  168  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.65 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  37.45 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 247 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 247 aa  165  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 247 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 247 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  37.15 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  39.22 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0612  tRNA pseudouridine synthase A  42.13 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  38 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  40.46 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  39.44 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  40.78 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5154  tRNA pseudouridine synthase A  41.34 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  38.4 
 
 		 264 aa  154  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  35.06 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  40.94 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  32.68 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4476  tRNA pseudouridine synthase A  39.84 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  40.94 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  35.97 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0595  tRNA pseudouridine synthase A  40.07 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  37.7 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4288  tRNA pseudouridine synthase A  40.94 
 
 		 288 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.620065  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3109  tRNA pseudouridine synthase A  40.54 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03101  tRNA pseudouridine synthase A  38 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  34.68 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  37.05 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  37.45 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  38.25 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  38.19 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  38 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  34.26 
 
 		 245 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  40.55 
 
 		 271 aa  148  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  33.86 
 
 		 245 aa  148  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  34.92 
 
 		 245 aa  148  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.89 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  38.34 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  35.74 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6020  tRNA pseudouridine synthase A  41.11 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0748411  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  36.4 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  40.32 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  40.32 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  34.25 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1051  tRNA pseudouridine synthase A  33.96 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.238902 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  36.8 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  36.8 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  34.52 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  34.65 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  36.8 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  36.8 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  36.8 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  34.65 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  36.8 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  36.8 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  39.6 
 
 		 271 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0966  tRNA pseudouridine synthase A  39.53 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.982634  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  35.08 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23260  pseudouridylate synthase I  40.73 
 
 		 346 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3871  tRNA pseudouridine synthase A  38.4 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  36.4 
 
 		 267 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  35.6 
 
 		 245 aa  145  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1234  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 		 261 aa  145  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.512181  normal  0.233712 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 		 245 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  39.29 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  36.11 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1337  tRNA pseudouridine synthase A  38.55 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.354676  normal  0.497364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  38.4 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  34.8 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  36.8 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2071  tRNA pseudouridine synthase A  37.35 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.179151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  34.77 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1729  tRNA pseudouridine synthase A  37.35 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992895  hitchhiker  0.00555362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1217  tRNA pseudouridine synthase A  38.26 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106552 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  34.01 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2653  tRNA pseudouridine synthase A  37.64 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  34.01 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0615  tRNA pseudouridine synthase A  38.93 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2616  tRNA pseudouridine synthase A  39.13 
 
 		 296 aa  142  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0770  tRNA pseudouridine synthase A  35.36 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>