More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1368 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1368  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 
261 aa  518  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2123  tRNA pseudouridine synthase A  51.26 
 
 
257 aa  205  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.521479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  38.68 
 
 
248 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  34.17 
 
 
244 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0483  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0336  tRNA pseudouridine synthase A  43.51 
 
 
297 aa  158  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0521282  decreased coverage  0.000493402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  38.27 
 
 
247 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  41.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2616  tRNA pseudouridine synthase A  43.5 
 
 
296 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  38.75 
 
 
271 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 
261 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  36.93 
 
 
258 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  37.3 
 
 
250 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  34.3 
 
 
244 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  33.75 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  39.09 
 
 
252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1933  tRNA pseudouridine synthase A  34.85 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6581  tRNA-pseudouridine synthase I  44.67 
 
 
314 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.22035  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5154  tRNA pseudouridine synthase A  42.37 
 
 
279 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4288  tRNA pseudouridine synthase A  43.9 
 
 
288 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.620065  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4667  tRNA pseudouridine synthase A  32.08 
 
 
284 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  31.97 
 
 
247 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  37.74 
 
 
270 aa  148  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  33.61 
 
 
249 aa  148  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  38.96 
 
 
256 aa  148  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  38.96 
 
 
270 aa  148  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  38.67 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  38.67 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0612  tRNA pseudouridine synthase A  42.98 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  38.67 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  38.67 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  38.67 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  38.67 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  38.67 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3109  tRNA pseudouridine synthase A  44.96 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  32.1 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  32.1 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  32.1 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04290  pseudouridylate synthase I  42.31 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477492  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  32.1 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  32.1 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  32.1 
 
 
247 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 
252 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  31.28 
 
 
252 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  35.66 
 
 
247 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 
252 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 
252 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0595  tRNA pseudouridine synthase A  41.13 
 
 
294 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  32.92 
 
 
245 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  37.74 
 
 
270 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  37.74 
 
 
267 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1729  tRNA pseudouridine synthase A  39.58 
 
 
271 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992895  hitchhiker  0.00555362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2071  tRNA pseudouridine synthase A  39.58 
 
 
271 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.179151  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2502  tRNA pseudouridine synthase A  36.1 
 
 
248 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419434  normal  0.63805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2620  tRNA pseudouridine synthase A  41.83 
 
 
306 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1013  tRNA pseudouridine synthase A  34.16 
 
 
245 aa  141  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00481076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  39.17 
 
 
266 aa  142  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1129  tRNA pseudouridine synthase A  37.75 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  40.5 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1744  tRNA pseudouridine synthase A  36.93 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  36.96 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  38.21 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  31.4 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  31.4 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2726  tRNA pseudouridine synthase A  38.91 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  35 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1150  tRNA pseudouridine synthase A  41.49 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00189497  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0037  tRNA pseudouridine synthase A  42.17 
 
 
266 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1234  tRNA pseudouridine synthase A  39.6 
 
 
261 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.512181  normal  0.233712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3871  tRNA pseudouridine synthase A  41.87 
 
 
268 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  34.3 
 
 
245 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2275  tRNA pseudouridine synthase A  35.46 
 
 
268 aa  137  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0551657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 
245 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  33.88 
 
 
246 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  33.88 
 
 
246 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1914  tRNA pseudouridine synthase A  35.48 
 
 
351 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 
264 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4476  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 
282 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29400  pseudouridylate synthase I  39.77 
 
 
287 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1432  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  39.75 
 
 
245 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  37.35 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  36.51 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000753277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4191  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 
245 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.88 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0498  tRNA pseudouridine synthase A  38.02 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276937  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  29.8 
 
 
248 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  29.8 
 
 
248 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1132  tRNA pseudouridine synthase A  38.35 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3380  tRNA pseudouridine synthase A  42.56 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1144  tRNA pseudouridine synthase A  38.28 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  33.75 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1115  tRNA pseudouridine synthase A  38.35 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  34.58 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  31.12 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  37.75 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  36.63 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13523  putative tRNA pseudouridine synthase A  35.42 
 
 
258 aa  133  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>