More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1685 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 244 aa  502  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  54.92 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  52.46 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  54.51 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  54.51 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  51.84 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  47.95 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  48.58 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  47.54 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  44.67 
 
 		 249 aa  224  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  44.49 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  46.31 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000753277  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  44.35 
 
 		 248 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  44.35 
 
 		 248 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  45.08 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  44.49 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  44.31 
 
 		 246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  44.26 
 
 		 264 aa  219  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  46.72 
 
 		 246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  46.72 
 
 		 246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  45.08 
 
 		 262 aa  218  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  44.94 
 
 		 250 aa  218  6e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  41.8 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  41.39 
 
 		 258 aa  208  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  43.67 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  40.98 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  41.63 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  44.9 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  43.03 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  43.44 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  42.45 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 245 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 245 aa  198  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 245 aa  198  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 245 aa  198  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 245 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  42.45 
 
 		 247 aa  198  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 245 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  39.42 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  44.31 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  39.42 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  38.11 
 
 		 266 aa  194  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  39.42 
 
 		 261 aa  194  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  41.39 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  39.42 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  39 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2726  tRNA pseudouridine synthase A  40 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  38.11 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0841  tRNA pseudouridine synthase A  40.91 
 
 		 305 aa  192  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258098  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  38.52 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0879  tRNA pseudouridine synthase A  41.7 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  38.59 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0126  tRNA pseudouridine synthase A  41.34 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2306  tRNA pseudouridine synthase A  38.59 
 
 		 261 aa  188  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0438465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  38.93 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  39 
 
 		 264 aa  188  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  39.42 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1251  tRNA pseudouridine synthase A  38.62 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124214  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1266  tRNA pseudouridine synthase A  39 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  40 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  37.76 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  38.02 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1617  tRNA pseudouridine synthase A  37.76 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2742  tRNA pseudouridine synthase A  37.76 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0368715  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  39.26 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  39.29 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1931  tRNA pseudouridine synthase A  37.66 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  37.3 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  37.86 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03101  tRNA pseudouridine synthase A  39 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  36.4 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4191  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  38.84 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  41.15 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2598  tRNA pseudouridine synthase A  37.76 
 
 		 270 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.814522  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2719  tRNA pseudouridine synthase A  37.76 
 
 		 270 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.152064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1444  tRNA pseudouridine synthase A  39.61 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2610  tRNA pseudouridine synthase A  37.76 
 
 		 270 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  0.0539335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2510  tRNA pseudouridine synthase A  37.76 
 
 		 270 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2556  tRNA pseudouridine synthase A  37.76 
 
 		 270 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  36.07 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  40.73 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1033  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0974  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>