More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0407 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 245 aa  508  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  95.51 
 
 		 245 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  95.51 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  95.51 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  94.29 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  94.29 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  94.29 
 
 		 245 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  94.29 
 
 		 245 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  94.29 
 
 		 245 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  93.47 
 
 		 245 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  85.31 
 
 		 260 aa  447  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  46.09 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  45.68 
 
 		 248 aa  241  9e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  44.72 
 
 		 245 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  43.75 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0879  tRNA pseudouridine synthase A  44.13 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  40.08 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  44.08 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  41.63 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  44.08 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  40.66 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  40.66 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  40.08 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  39.59 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  39.68 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  38.75 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  40.33 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  40.8 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  36.33 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1033  tRNA pseudouridine synthase A  39.11 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0974  tRNA pseudouridine synthase A  39.11 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 		 259 aa  181  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 271 aa  180  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  38.6 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  38.84 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  35.77 
 
 		 245 aa  178  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  35.83 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  37.7 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  37.28 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0126  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1346  tRNA pseudouridine synthase A  38.31 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  38.78 
 
 		 250 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2717  tRNA pseudouridine synthase A  38.59 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0374382 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  33.75 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3695  tRNA pseudouridine synthase A  36.18 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0391  tRNA pseudouridine synthase A  38.71 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  32.24 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  38.87 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  35.1 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000753277  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  36.99 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  35.39 
 
 		 262 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3148  tRNA pseudouridine synthase A  35.6 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733437  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  35.1 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  36.67 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  35.42 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2251  tRNA pseudouridine synthase A  38.46 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218051  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0447  tRNA pseudouridine synthase A  34.55 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.801238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  36.99 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  32.24 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0540  tRNA pseudouridine synthase A  35.89 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.999285  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  32.24 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  34.29 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  35.42 
 
 		 270 aa  168  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  37.55 
 
 		 261 aa  168  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2306  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0438465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3066  tRNA pseudouridine synthase A  34.96 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301608  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  37.13 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1321  tRNA pseudouridine synthase A  36.29 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0263  tRNA pseudouridine synthase A  36.59 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  37.13 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  35.83 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  34.96 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4191  tRNA pseudouridine synthase A  36.07 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1916  tRNA pseudouridine synthase A  36.4 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>