More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1150 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1150  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00189497  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  42.68 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  39.75 
 
 		 248 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  33.76 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  41.06 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  38.59 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  42.45 
 
 		 250 aa  175  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  38.15 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  37.55 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  36.02 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  38.68 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  36.07 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0223  tRNA pseudouridine synthase A  38.4 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00472694  normal  0.027676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0226  tRNA pseudouridine synthase A  38.4 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  37.15 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  41.15 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  32.91 
 
 		 244 aa  162  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  36.55 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  36.55 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3352  pseudouridylate synthase  39.53 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  37.7 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  33.73 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1068  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  34.96 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  39.08 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  35.39 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0126  tRNA pseudouridine synthase A  35.32 
 
 		 264 aa  158  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  34.45 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  38.91 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2275  tRNA pseudouridine synthase A  35.22 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0551657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  34.73 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  34.45 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  35.2 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1104  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.723318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  39.84 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0012  tRNA pseudouridine synthase A  32.11 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2111  tRNA pseudouridine synthase A  38.87 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.110217 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  31.95 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  31.95 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19791  tRNA pseudouridine synthase A  35.1 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  36.1 
 
 		 250 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2251  tRNA pseudouridine synthase A  38.46 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218051  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.73 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  37.14 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1130  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.131343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3462  tRNA pseudouridine synthase A  36.86 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.209779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  38.52 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  37.04 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0391  tRNA pseudouridine synthase A  37.25 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16094  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4667  tRNA pseudouridine synthase A  32.51 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  37.82 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2502  tRNA pseudouridine synthase A  34.65 
 
 		 248 aa  151  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419434  normal  0.63805 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  36.55 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0419  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.293905  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2384  tRNA pseudouridine synthase A  37.94 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  35.44 
 
 		 244 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  34.51 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1033  tRNA pseudouridine synthase A  35.22 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  33.61 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0974  tRNA pseudouridine synthase A  35.22 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0447  tRNA pseudouridine synthase A  37.35 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.801238 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.59 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  38.31 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0540  tRNA pseudouridine synthase A  38.06 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.999285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01204  tRNA pseudouridine synthase A  35.43 
 
 		 264 aa  148  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  35.08 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3148  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733437  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2224  tRNA pseudouridine synthase A  38.04 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0737509  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1555  tRNA pseudouridine synthase A  37.45 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1916  tRNA pseudouridine synthase A  38.11 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.974239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34220  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1318  tRNA pseudouridine synthase A  36.4 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620089  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1896  tRNA pseudouridine synthase A  36.07 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0483  tRNA pseudouridine synthase A  36.65 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1931  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 		 302 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1321  tRNA pseudouridine synthase A  33.6 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1380  tRNA pseudouridine synthase A  37.34 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0020  tRNA pseudouridine synthase A  36.07 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2726  tRNA pseudouridine synthase A  35.58 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  38.37 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  35.25 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  37.13 
 
 		 256 aa  144  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  35.8 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1346  tRNA pseudouridine synthase A  35.22 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1914  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 351 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000401865  normal  0.634585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>