More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3462 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3462  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 261 aa  538  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.209779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2224  tRNA pseudouridine synthase A  67.06 
 
 		 255 aa  343  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0737509  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0571  tRNA pseudouridine synthase A  66.67 
 
 		 255 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217469  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0502  tRNA pseudouridine synthase A  67.84 
 
 		 257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  0.200286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1938  tRNA pseudouridine synthase A  67.72 
 
 		 257 aa  334  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  hitchhiker  0.0000799616 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2384  tRNA pseudouridine synthase A  61.57 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0534  tRNA pseudouridine synthase A  62.55 
 
 		 261 aa  331  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0447  tRNA pseudouridine synthase A  55.42 
 
 		 249 aa  276  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.801238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0498  tRNA pseudouridine synthase A  53.97 
 
 		 260 aa  261  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1130  tRNA pseudouridine synthase A  52.99 
 
 		 248 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.131343 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0248  tRNA pseudouridine synthase A  51.81 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4567  tRNA pseudouridine synthase A  52 
 
 		 249 aa  255  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0059  tRNA pseudouridine synthase A  51.39 
 
 		 268 aa  254  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933928  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0263  tRNA pseudouridine synthase A  52.4 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0076  tRNA pseudouridine synthase A  51.39 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0056  tRNA pseudouridine synthase A  51.39 
 
 		 247 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0540  tRNA pseudouridine synthase A  50.39 
 
 		 259 aa  244  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.999285  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1033  tRNA pseudouridine synthase A  51 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1346  tRNA pseudouridine synthase A  51 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0974  tRNA pseudouridine synthase A  51 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  49.8 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0391  tRNA pseudouridine synthase A  53.39 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16094  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3695  tRNA pseudouridine synthase A  51.81 
 
 		 245 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3066  tRNA pseudouridine synthase A  51.6 
 
 		 255 aa  238  9e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301608  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3352  pseudouridylate synthase  47.79 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3148  tRNA pseudouridine synthase A  46.8 
 
 		 253 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733437  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0348  tRNA pseudouridine synthase A  51.16 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489458  normal  0.0429336 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2893  tRNA pseudouridine synthase A  49 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7335  tRNA pseudouridine synthase A  52.4 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0419  tRNA pseudouridine synthase A  45.16 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.293905  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1321  tRNA pseudouridine synthase A  47.01 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0675  tRNA pseudouridine synthase A  51.41 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0807  tRNA pseudouridine synthase A  50.2 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0079  tRNA pseudouridine synthase A  51.81 
 
 		 245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.594696  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_002978  WD1068  tRNA pseudouridine synthase A  43.55 
 
 		 245 aa  221  9e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4041  tRNA pseudouridine synthase A  50.6 
 
 		 254 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31208  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0622  tRNA pseudouridine synthase A  41.94 
 
 		 245 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.939748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0627  tRNA pseudouridine synthase A  51.41 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.801846  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1600  tRNA pseudouridine synthase A  44.62 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535619  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1634  tRNA pseudouridine synthase A  43.78 
 
 		 250 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1916  tRNA pseudouridine synthase A  43.37 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  45.02 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4747  tRNA pseudouridine synthase A  46.22 
 
 		 254 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0411  tRNA pseudouridine synthase A  45.31 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451787  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0020  tRNA pseudouridine synthase A  40.73 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  41.9 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  40.39 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  42.97 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  39.29 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  40.77 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2071  tRNA pseudouridine synthase A  42.51 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.179151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1729  tRNA pseudouridine synthase A  42.51 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992895  hitchhiker  0.00555362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  41.77 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  41.96 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  38.55 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  38.91 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2159  tRNA pseudouridine synthase A  40.87 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0844535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1914  tRNA pseudouridine synthase A  39.36 
 
 		 351 aa  166  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  41.04 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  41.04 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  41.5 
 
 		 274 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  40.96 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  37.85 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  40.96 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  40.96 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  40.96 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  36.59 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  40.96 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  34.71 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  38.19 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03101  tRNA pseudouridine synthase A  38.74 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  38.98 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  38.34 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  40.94 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  40.32 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  38.49 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  39.76 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  38.1 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  37.94 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1555  tRNA pseudouridine synthase A  40.08 
 
 		 284 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  32.93 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  39.75 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2469  tRNA pseudouridine synthase A  37.94 
 
 		 278 aa  158  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  32.93 
 
 		 244 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1234  tRNA pseudouridine synthase A  39.53 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.512181  normal  0.233712 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  41.04 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  36.95 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3237  tRNA pseudouridine synthase A  36.78 
 
 		 274 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  34 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  34 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1337  tRNA pseudouridine synthase A  40.38 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.354676  normal  0.497364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  38.4 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  37.45 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  34 
 
 		 245 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2308  tRNA pseudouridine synthase A  38.04 
 
 		 273 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.742773  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2306  tRNA pseudouridine synthase A  37.75 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0438465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  37.7 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  37.7 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>