More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1068 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1068  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 245 aa  511  1e-144  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0454345  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0622  tRNA pseudouridine synthase A  60.41 
 
 		 245 aa  317  9e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.939748  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0419  tRNA pseudouridine synthase A  60.82 
 
 		 245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.293905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3695  tRNA pseudouridine synthase A  49.18 
 
 		 245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3066  tRNA pseudouridine synthase A  48.77 
 
 		 255 aa  250  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301608  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0391  tRNA pseudouridine synthase A  50 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16094  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0447  tRNA pseudouridine synthase A  47.13 
 
 		 249 aa  249  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.801238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0675  tRNA pseudouridine synthase A  50 
 
 		 245 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3352  pseudouridylate synthase  45.71 
 
 		 278 aa  245  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0079  tRNA pseudouridine synthase A  50 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.594696  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7335  tRNA pseudouridine synthase A  48.36 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326558  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1033  tRNA pseudouridine synthase A  46.75 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0974  tRNA pseudouridine synthase A  46.75 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0020  tRNA pseudouridine synthase A  50 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3148  tRNA pseudouridine synthase A  46.37 
 
 		 253 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733437  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1346  tRNA pseudouridine synthase A  46.34 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1130  tRNA pseudouridine synthase A  46.72 
 
 		 248 aa  241  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.131343 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1321  tRNA pseudouridine synthase A  46.34 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0627  tRNA pseudouridine synthase A  47.95 
 
 		 245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.801846  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0540  tRNA pseudouridine synthase A  47.15 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.999285  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0263  tRNA pseudouridine synthase A  46.72 
 
 		 246 aa  238  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1916  tRNA pseudouridine synthase A  45.97 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1600  tRNA pseudouridine synthase A  45.56 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535619  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0807  tRNA pseudouridine synthase A  48.77 
 
 		 245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0076  tRNA pseudouridine synthase A  45.53 
 
 		 272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0498  tRNA pseudouridine synthase A  46.31 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  45.08 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1634  tRNA pseudouridine synthase A  45.97 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0059  tRNA pseudouridine synthase A  44.72 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933928  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0248  tRNA pseudouridine synthase A  44.26 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  44.67 
 
 		 245 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3462  tRNA pseudouridine synthase A  43.55 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.209779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2384  tRNA pseudouridine synthase A  43.95 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0056  tRNA pseudouridine synthase A  43.5 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478074 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0571  tRNA pseudouridine synthase A  43.15 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217469  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4747  tRNA pseudouridine synthase A  45.9 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2224  tRNA pseudouridine synthase A  43.15 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0737509  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4567  tRNA pseudouridine synthase A  44.26 
 
 		 249 aa  222  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2893  tRNA pseudouridine synthase A  42.28 
 
 		 254 aa  221  9e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1938  tRNA pseudouridine synthase A  44.35 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  hitchhiker  0.0000799616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0502  tRNA pseudouridine synthase A  43.95 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  0.200286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0534  tRNA pseudouridine synthase A  43.82 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  44.58 
 
 		 271 aa  211  7.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4041  tRNA pseudouridine synthase A  41.8 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31208  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0348  tRNA pseudouridine synthase A  44.94 
 
 		 258 aa  204  8e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489458  normal  0.0429336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0411  tRNA pseudouridine synthase A  43.9 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451787  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  41.63 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  43.15 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1018  pseudouridylate synthase  42.74 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  41.77 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  41.32 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  41.32 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2159  tRNA pseudouridine synthase A  40 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0844535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 252 aa  185  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1337  tRNA pseudouridine synthase A  41.8 
 
 		 269 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.354676  normal  0.497364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1896  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  41.74 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23840  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2019  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0292827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  42.56 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  43.32 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3817  tRNA pseudouridine synthase A  40.82 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1251  tRNA pseudouridine synthase A  40.24 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  40.64 
 
 		 261 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1234  tRNA pseudouridine synthase A  40.56 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.512181  normal  0.233712 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  39.18 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1258  tRNA pseudouridine synthase A  41.13 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1662  tRNA pseudouridine synthase A  39.59 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.192563  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2717  tRNA pseudouridine synthase A  41.06 
 
 		 287 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0374382 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1729  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 		 271 aa  178  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992895  hitchhiker  0.00555362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  37.55 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2071  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 		 271 aa  178  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.179151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  40.82 
 
 		 261 aa  178  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  41.46 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3614  tRNA pseudouridine synthase A  38.96 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421656  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03101  tRNA pseudouridine synthase A  40.24 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3458  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2474  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2696  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  39.84 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2469  tRNA pseudouridine synthase A  39.76 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1555  tRNA pseudouridine synthase A  39.18 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2612  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  39.26 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  39.26 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  37.7 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  40.64 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  41.06 
 
 		 261 aa  175  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  38.8 
 
 		 274 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>