More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0686 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  63.41 
 
 		 245 aa  331  8e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  65.45 
 
 		 244 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  61.79 
 
 		 245 aa  323  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  55.69 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  43.09 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  42.45 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 252 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  42.04 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  42.04 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  42.04 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  42.04 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  42.04 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  42.04 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  42.45 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  41.94 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  42.04 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  41.53 
 
 		 248 aa  185  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  41.06 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  41.87 
 
 		 244 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  36.18 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  37.66 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  38.02 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1051  tRNA pseudouridine synthase A  38.25 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000873816  hitchhiker  0.00519599 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28572  predicted protein  38.76 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0301527  hitchhiker  0.000000212396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  37.6 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  38.71 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  38.46 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  36.44 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 		 244 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  36.44 
 
 		 245 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  40.65 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  40.65 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  36.44 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  36.03 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  37.3 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  35.22 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  36.99 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  36.44 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  37.3 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  36.44 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  39.76 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  36.59 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  37.65 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.55 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  38.21 
 
 		 264 aa  159  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  36.03 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  36.03 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  37.96 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  36.03 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0502  tRNA pseudouridine synthase A  37.1 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  0.200286 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  35.08 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  34.82 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  35.08 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  35.6 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_446  pseudouridylate synthase  39.41 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000332106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  36.33 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  34.41 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  37.19 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.55 
 
 		 270 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  37.19 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  35.37 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  34.27 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  36.03 
 
 		 244 aa  154  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 261 aa  154  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2224  tRNA pseudouridine synthase A  36.65 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0737509  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0571  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217469  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0481  tRNA pseudouridine synthase A  39.83 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000089193  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  36.76 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  35.63 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0504  tRNA pseudouridine synthase A  38.98 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00170943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0056  tRNA pseudouridine synthase A  36.03 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  37.25 
 
 		 289 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17151  tRNA pseudouridine synthase A  41.39 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.137278  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21360  pseudouridylate synthase I  38.58 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0418388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  37.19 
 
 		 264 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  34.02 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  34.68 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  36.99 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  36.48 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  34.29 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1033  tRNA pseudouridine synthase A  35.08 
 
 		 251 aa  152  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  35.22 
 
 		 244 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0974  tRNA pseudouridine synthase A  35.08 
 
 		 251 aa  152  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.95 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 261 aa  151  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  37.55 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03101  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3871  tRNA pseudouridine synthase A  35.74 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1729  tRNA pseudouridine synthase A  35.56 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992895  hitchhiker  0.00555362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2071  tRNA pseudouridine synthase A  35.56 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.179151  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1346  tRNA pseudouridine synthase A  36.29 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  36.89 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01204  tRNA pseudouridine synthase A  36.59 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0419  tRNA pseudouridine synthase A  38.52 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.293905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0612  tRNA pseudouridine synthase A  35.77 
 
 		 274 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0336  tRNA pseudouridine synthase A  34.88 
 
 		 297 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0521282  decreased coverage  0.000493402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>