More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28572 on replicon NC_009373
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009373  OSTLU_28572  predicted protein  100 
 
 
286 aa  593  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0301527  hitchhiker  0.000000212396 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.76 
 
 
246 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  36.96 
 
 
248 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  35.36 
 
 
260 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  36.58 
 
 
248 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  38.7 
 
 
250 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  34.65 
 
 
245 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  34.65 
 
 
245 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  37.94 
 
 
246 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  37.94 
 
 
246 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  34.65 
 
 
245 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  34.25 
 
 
245 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  34.65 
 
 
245 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0126  tRNA pseudouridine synthase A  38.02 
 
 
264 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  34.25 
 
 
245 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  34.25 
 
 
245 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  39.76 
 
 
247 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  33.86 
 
 
245 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  34.25 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  39.84 
 
 
248 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  33.86 
 
 
245 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  39.77 
 
 
258 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  37.85 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  37.94 
 
 
244 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  37.25 
 
 
249 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  40.55 
 
 
250 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  36.29 
 
 
255 aa  149  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  36.92 
 
 
258 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  37.85 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  37.85 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  37.85 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  38.25 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  37.85 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.61 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  37.85 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  37.45 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  37.45 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  39.3 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  37.45 
 
 
252 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 
252 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  34.39 
 
 
244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  35.27 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.82 
 
 
244 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  37.84 
 
 
245 aa  145  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  37.05 
 
 
252 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  36.29 
 
 
256 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4191  tRNA pseudouridine synthase A  38.74 
 
 
245 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  35.83 
 
 
245 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  39.13 
 
 
245 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  39.13 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  39.13 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  36.68 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2019  tRNA pseudouridine synthase A  35 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0292827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  36.96 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.05 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  34.65 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  34.65 
 
 
244 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23840  tRNA pseudouridine synthase A  35 
 
 
285 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866913  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  35.69 
 
 
253 aa  139  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000401865  normal  0.634585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  36.54 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1544  tRNA pseudouridine synthase A  37.36 
 
 
272 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2717  tRNA pseudouridine synthase A  34.62 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0374382 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0879  tRNA pseudouridine synthase A  36.08 
 
 
248 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  32.59 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  32.59 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  34.07 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2726  tRNA pseudouridine synthase A  36.58 
 
 
259 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  35.23 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2251  tRNA pseudouridine synthase A  37.25 
 
 
246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218051  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  34.51 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  33.98 
 
 
262 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  35.18 
 
 
245 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.29 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1266  tRNA pseudouridine synthase A  33.98 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34220  tRNA pseudouridine synthase A  33.85 
 
 
288 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3767  tRNA pseudouridine synthase A  34.33 
 
 
332 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  33.83 
 
 
262 aa  132  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  38.11 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2275  tRNA pseudouridine synthase A  33.83 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0551657  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1528  tRNA pseudouridine synthase A  33.72 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141519  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2410  tRNA pseudouridine synthase A  36.98 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.293969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1219  tRNA pseudouridine synthase A  36.92 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2322  tRNA pseudouridine synthase A  36.98 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1555  tRNA pseudouridine synthase A  33.97 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  34.63 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  33.99 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0595  tRNA pseudouridine synthase A  35.71 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3380  tRNA pseudouridine synthase A  35.77 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  32.22 
 
 
274 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  33.46 
 
 
252 aa  130  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 
244 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000753277  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  35.41 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  34.62 
 
 
271 aa  129  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  36.43 
 
 
247 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1931  tRNA pseudouridine synthase A  32.95 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797555  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2616  tRNA pseudouridine synthase A  35.77 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1175  tRNA pseudouridine synthase A  34.25 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.261971  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  33.72 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1969  tRNA pseudouridine synthase A  33.46 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0481  tRNA pseudouridine synthase A  37.01 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000089193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>