More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2995 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  100 
 
 		 278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  57.43 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  56.63 
 
 		 270 aa  260  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4942  tRNA pseudouridine synthase ACD  49 
 
 		 272 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  42.34 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  40.73 
 
 		 244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  43.37 
 
 		 259 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0037  tRNA pseudouridine synthase A  46.22 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  38.31 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  40.32 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  39.11 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  36.9 
 
 		 248 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  36.9 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  41.94 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  42.4 
 
 		 270 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  41.04 
 
 		 252 aa  175  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0481  tRNA pseudouridine synthase A  41.8 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000089193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  43.02 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0504  tRNA pseudouridine synthase A  42.21 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00170943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  41.43 
 
 		 262 aa  175  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_446  pseudouridylate synthase  41.39 
 
 		 246 aa  175  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000332106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  41.83 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  39.11 
 
 		 259 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 244 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  40.56 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  40.3 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  37.9 
 
 		 244 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  38.2 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  40.48 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1914  tRNA pseudouridine synthase A  42.58 
 
 		 351 aa  169  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  40.48 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  38.15 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  40.08 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  40.56 
 
 		 245 aa  169  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  38.15 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.55 
 
 		 244 aa  169  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  37.35 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  38.15 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  38.55 
 
 		 252 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  38.55 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  38.55 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  38.55 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  38.55 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  38.55 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  38.55 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  38.31 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  39.84 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  38.31 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  39.6 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1560  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.949883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  39.45 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  41.13 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  38.21 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03101  tRNA pseudouridine synthase A  38.21 
 
 		 264 aa  165  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  38.62 
 
 		 261 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1617  tRNA pseudouridine synthase A  38.62 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  37.96 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2742  tRNA pseudouridine synthase A  38.62 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0368715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3148  tRNA pseudouridine synthase A  41.27 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733437  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1729  tRNA pseudouridine synthase A  42.45 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992895  hitchhiker  0.00555362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  41.2 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2071  tRNA pseudouridine synthase A  42.45 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.179151  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  39.76 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  41.73 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2019  tRNA pseudouridine synthase A  40.08 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0292827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1465  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1258  tRNA pseudouridine synthase A  38.62 
 
 		 269 aa  162  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 		 261 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  42.97 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  41.73 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1234  tRNA pseudouridine synthase A  41.46 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.512181  normal  0.233712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23840  tRNA pseudouridine synthase A  40.08 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  43.6 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  38.55 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2719  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.152064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2556  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2598  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.814522  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2610  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  0.0539335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2510  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  38.15 
 
 		 250 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 244 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  38.21 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  41.46 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  37.37 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2111  tRNA pseudouridine synthase A  41.41 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.110217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  39.36 
 
 		 263 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1051  tRNA pseudouridine synthase A  35.55 
 
 		 276 aa  159  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.238902 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 267 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>