More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0490 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  100 
 
 		 890 aa  1821    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  29.2 
 
 		 1010 aa  296  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  29.96 
 
 		 917 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  30.2 
 
 		 914 aa  284  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 996 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  29.47 
 
 		 996 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  29.49 
 
 		 996 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  28.68 
 
 		 1004 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  29.6 
 
 		 995 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  29.35 
 
 		 971 aa  268  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  29.94 
 
 		 978 aa  267  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  27.94 
 
 		 1042 aa  248  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  30.1 
 
 		 972 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  28.37 
 
 		 996 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  26.58 
 
 		 1020 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2360  UvrD/REP helicase  28.35 
 
 		 955 aa  232  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  27.07 
 
 		 957 aa  230  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  25.72 
 
 		 916 aa  213  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  30.81 
 
 		 684 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  30.81 
 
 		 684 aa  175  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  30.81 
 
 		 684 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  30.81 
 
 		 684 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  30.53 
 
 		 684 aa  172  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  32.05 
 
 		 684 aa  170  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  36.33 
 
 		 699 aa  167  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  30.88 
 
 		 685 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  31.54 
 
 		 685 aa  164  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  31.09 
 
 		 684 aa  162  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  31.09 
 
 		 684 aa  162  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  30.51 
 
 		 684 aa  161  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  30.51 
 
 		 684 aa  161  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  30.51 
 
 		 684 aa  161  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  30.51 
 
 		 684 aa  161  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  30.51 
 
 		 684 aa  161  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  31.09 
 
 		 684 aa  162  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  30.51 
 
 		 684 aa  161  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  30.23 
 
 		 684 aa  160  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  30.23 
 
 		 684 aa  160  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  30.23 
 
 		 684 aa  160  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  31.61 
 
 		 685 aa  159  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  31.21 
 
 		 685 aa  157  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  30.42 
 
 		 684 aa  155  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  31.51 
 
 		 689 aa  149  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  33.02 
 
 		 689 aa  148  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  33.23 
 
 		 687 aa  135  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2969  UvrD/REP helicase  28.02 
 
 		 834 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.17586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  28.57 
 
 		 728 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  28.57 
 
 		 728 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46270  putative helicase  24.62 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200631  normal  0.0695231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3935  putative helicase  25.09 
 
 		 649 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0740  UvrD/REP helicase  29.41 
 
 		 692 aa  76.3  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.336615  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1137  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  36.05 
 
 		 745 aa  76.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.931855  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  23.6 
 
 		 726 aa  75.1  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  27.36 
 
 		 616 aa  73.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2565  UvrD/REP helicase  26.46 
 
 		 714 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.25 
 
 		 745 aa  72.8  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3150  UvrD/REP helicase  26.46 
 
 		 834 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0055  UvrD/REP helicase  31.47 
 
 		 1112 aa  72.8  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  30.06 
 
 		 620 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.9 
 
 		 670 aa  72.4  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  23.72 
 
 		 709 aa  72  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  23.72 
 
 		 709 aa  72  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  40.66 
 
 		 671 aa  71.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3303  UvrD/REP helicase  26.07 
 
 		 814 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  27.62 
 
 		 727 aa  71.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.99 
 
 		 725 aa  71.2  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  31.5 
 
 		 1180 aa  71.2  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 		 1107 aa  71.2  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  27.05 
 
 		 719 aa  70.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  32.47 
 
 		 760 aa  70.5  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4325  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.21 
 
 		 671 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2511  UvrD/REP helicase  28.4 
 
 		 797 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  35.04 
 
 		 797 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  35.04 
 
 		 797 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  32.77 
 
 		 779 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.404442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0376  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.21 
 
 		 671 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.158989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3650  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.21 
 
 		 671 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  33.59 
 
 		 706 aa  69.7  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 684 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3233  UvrD/REP helicase  25.51 
 
 		 628 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.889019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  30.67 
 
 		 666 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3599  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.44 
 
 		 670 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  25.95 
 
 		 728 aa  68.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0374  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.21 
 
 		 671 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  27.61 
 
 		 677 aa  68.9  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 1177 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  29.45 
 
 		 728 aa  68.6  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2672  UvrD/REP helicase  27.52 
 
 		 824 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.221431  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  30.22 
 
 		 1016 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  27.35 
 
 		 731 aa  68.6  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.19 
 
 		 797 aa  68.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  30 
 
 		 773 aa  68.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 738 aa  68.6  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  25.75 
 
 		 728 aa  68.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  26.78 
 
 		 744 aa  68.2  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  29.58 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3990  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.07 
 
 		 670 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4106  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.33 
 
 		 685 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  26.04 
 
 		 656 aa  68.2  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3913  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.07 
 
 		 670 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>