More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0290 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  100 
 
 		 1010 aa  2115    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  36.94 
 
 		 995 aa  521  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  36.32 
 
 		 971 aa  513  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  37.15 
 
 		 996 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  36.96 
 
 		 996 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  36.92 
 
 		 996 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  36.39 
 
 		 1004 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  34.51 
 
 		 1042 aa  494  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  34.78 
 
 		 996 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  34.34 
 
 		 978 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  33.86 
 
 		 972 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 1020 aa  405  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  31.32 
 
 		 957 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2360  UvrD/REP helicase  29.02 
 
 		 955 aa  352  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  31.35 
 
 		 917 aa  349  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  32.12 
 
 		 914 aa  340  7e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  29.2 
 
 		 890 aa  296  2e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  27.8 
 
 		 916 aa  228  5.0000000000000005e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  35.61 
 
 		 685 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  36.18 
 
 		 685 aa  209  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  35.59 
 
 		 685 aa  208  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  37.9 
 
 		 684 aa  206  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  37.9 
 
 		 684 aa  206  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  37.58 
 
 		 684 aa  205  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  37.58 
 
 		 684 aa  205  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  37.58 
 
 		 684 aa  205  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  37.58 
 
 		 684 aa  205  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  35.04 
 
 		 685 aa  205  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  37.58 
 
 		 684 aa  205  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  37.58 
 
 		 684 aa  204  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  37.3 
 
 		 684 aa  204  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  37.3 
 
 		 684 aa  204  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  37.3 
 
 		 684 aa  204  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  37.3 
 
 		 684 aa  204  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  37.26 
 
 		 684 aa  203  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  37.3 
 
 		 684 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  37.81 
 
 		 684 aa  202  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  34.76 
 
 		 684 aa  202  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  36.53 
 
 		 684 aa  202  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  34.76 
 
 		 684 aa  202  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  37.9 
 
 		 684 aa  192  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  33.64 
 
 		 687 aa  191  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  32.36 
 
 		 689 aa  186  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  32.93 
 
 		 689 aa  185  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  34.37 
 
 		 699 aa  184  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  30.77 
 
 		 625 aa  87.4  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  26.27 
 
 		 682 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  32.54 
 
 		 1177 aa  87  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.94 
 
 		 689 aa  87  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  31.14 
 
 		 749 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  26.01 
 
 		 1041 aa  84  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.71 
 
 		 671 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.58 
 
 		 849 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  30.57 
 
 		 616 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  35.11 
 
 		 1180 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  31.76 
 
 		 666 aa  82.8  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 742 aa  82.8  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.82 
 
 		 814 aa  82  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3746  UvrD/REP helicase  30.17 
 
 		 730 aa  81.3  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  33.78 
 
 		 726 aa  81.3  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  32.5 
 
 		 706 aa  80.5  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  35.77 
 
 		 1048 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0661  UvrD/REP helicase  36.09 
 
 		 708 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612479  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  23.31 
 
 		 515 aa  80.1  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  28.75 
 
 		 741 aa  80.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3935  putative helicase  27.6 
 
 		 649 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0782  ATP-dependent DNA helicase  28.44 
 
 		 675 aa  80.5  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  32.17 
 
 		 736 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  29.05 
 
 		 666 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.25 
 
 		 837 aa  79.7  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  37.4 
 
 		 735 aa  79.7  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  45.74 
 
 		 754 aa  79  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.69 
 
 		 745 aa  79  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  42.98 
 
 		 816 aa  79  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.78 
 
 		 757 aa  79  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.39 
 
 		 781 aa  78.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  32.22 
 
 		 662 aa  78.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1323  hypothetical protein  50 
 
 		 190 aa  78.6  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0335284  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.22 
 
 		 662 aa  78.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  32.03 
 
 		 689 aa  77.8  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.64 
 
 		 864 aa  77.8  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0175  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.77 
 
 		 673 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  32.28 
 
 		 728 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  31.21 
 
 		 669 aa  77.8  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0507  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.77 
 
 		 673 aa  77.4  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0177061  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  34.51 
 
 		 723 aa  77.4  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  32.39 
 
 		 709 aa  77.4  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4038  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.77 
 
 		 673 aa  77.4  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  32.17 
 
 		 659 aa  77.4  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  25.71 
 
 		 736 aa  77.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  32.86 
 
 		 705 aa  77.4  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  36.22 
 
 		 671 aa  77.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  27.34 
 
 		 1016 aa  77.8  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.08 
 
 		 830 aa  77.4  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  31.97 
 
 		 746 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  30.99 
 
 		 666 aa  77.4  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  36.22 
 
 		 671 aa  77.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  30.63 
 
 		 798 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  32.39 
 
 		 709 aa  77.4  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  25.53 
 
 		 689 aa  76.6  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>