More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2360 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2360  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 955 aa  1981    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  34.67 
 
 		 995 aa  474  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  36.35 
 
 		 1004 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  33.84 
 
 		 996 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  32.79 
 
 		 996 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  34.77 
 
 		 996 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  34.32 
 
 		 996 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  35.93 
 
 		 971 aa  451  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  35.01 
 
 		 1042 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  35.1 
 
 		 978 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  33.91 
 
 		 972 aa  365  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  30.17 
 
 		 1020 aa  360  7e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  30.68 
 
 		 957 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  29.02 
 
 		 1010 aa  352  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  30.76 
 
 		 917 aa  294  6e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  29.37 
 
 		 914 aa  288  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  28.35 
 
 		 890 aa  232  3e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 916 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  36.52 
 
 		 684 aa  201  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  33.52 
 
 		 685 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  35.84 
 
 		 684 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  36.18 
 
 		 684 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  36.18 
 
 		 684 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  36.18 
 
 		 684 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  36.18 
 
 		 684 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  36.18 
 
 		 684 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  36.18 
 
 		 684 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  35.84 
 
 		 684 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  35.84 
 
 		 684 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  36.18 
 
 		 684 aa  199  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  35.84 
 
 		 684 aa  198  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  35.84 
 
 		 684 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  32.96 
 
 		 685 aa  198  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  36.79 
 
 		 684 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  36.79 
 
 		 684 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  36.79 
 
 		 684 aa  196  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  35.49 
 
 		 684 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  35.12 
 
 		 684 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  32.45 
 
 		 685 aa  189  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  34.8 
 
 		 685 aa  189  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  34.92 
 
 		 684 aa  182  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  35.59 
 
 		 689 aa  174  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  35.25 
 
 		 689 aa  173  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  32.21 
 
 		 687 aa  172  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  31.34 
 
 		 699 aa  163  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6473  UvrD/REP helicase  29.76 
 
 		 872 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.76 
 
 		 932 aa  85.5  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.15 
 
 		 781 aa  85.1  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.96 
 
 		 671 aa  84  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0661  UvrD/REP helicase  30.46 
 
 		 708 aa  84  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612479  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  33.8 
 
 		 679 aa  83.2  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  28.66 
 
 		 668 aa  82.8  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.69 
 
 		 755 aa  81.6  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1019 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.92 
 
 		 669 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.12 
 
 		 669 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.12 
 
 		 669 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.77 
 
 		 805 aa  79.7  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  27.66 
 
 		 746 aa  79.7  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  24.77 
 
 		 805 aa  79.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.92 
 
 		 669 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1715  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000356586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0339  UvrD/REP helicase  29.27 
 
 		 687 aa  78.6  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  31.11 
 
 		 1048 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.15 
 
 		 670 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.69 
 
 		 677 aa  77.4  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.66 
 
 		 754 aa  77  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5519  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.4 
 
 		 669 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  34.06 
 
 		 677 aa  77  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  29.53 
 
 		 685 aa  77  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.76 
 
 		 682 aa  77  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  31.69 
 
 		 677 aa  77.4  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0110  superfamily I DNA and RNA helicase  23.91 
 
 		 401 aa  77  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.285644  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.97 
 
 		 671 aa  76.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4012  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.28 
 
 		 670 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.6 
 
 		 773 aa  76.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0428  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.77 
 
 		 670 aa  77  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.64 
 
 		 669 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4106  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.28 
 
 		 685 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3913  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.28 
 
 		 670 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.17 
 
 		 706 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3329  UvrD/REP helicase  30.81 
 
 		 695 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544954  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  28.08 
 
 		 723 aa  75.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  27.48 
 
 		 724 aa  75.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.27 
 
 		 669 aa  75.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 		 742 aa  75.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  26.09 
 
 		 778 aa  75.5  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  30.97 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.84 
 
 		 725 aa  75.5  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3990  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.84 
 
 		 670 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.34 
 
 		 837 aa  75.1  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0406  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.33 
 
 		 670 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  30.32 
 
 		 671 aa  75.1  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.43 
 
 		 830 aa  75.1  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0253  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.27 
 
 		 669 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  32.12 
 
 		 671 aa  74.7  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.49 
 
 		 672 aa  74.7  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 706 aa  74.3  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3651  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.85 
 
 		 682 aa  74.3  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  31.97 
 
 		 734 aa  74.3  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>