More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1066 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  42.04 
 
 		 1066 aa  823    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1048 aa  2161    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  41.1 
 
 		 1041 aa  805    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 757 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  29.1 
 
 		 736 aa  199  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  28.15 
 
 		 765 aa  198  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  25.66 
 
 		 689 aa  197  8.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  26.94 
 
 		 722 aa  197  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  26.94 
 
 		 722 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  26.8 
 
 		 722 aa  196  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  26.8 
 
 		 722 aa  196  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  26.8 
 
 		 722 aa  196  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  26.31 
 
 		 666 aa  195  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  28.3 
 
 		 726 aa  194  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.74 
 
 		 739 aa  195  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  29.4 
 
 		 798 aa  193  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  27.49 
 
 		 714 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.89 
 
 		 772 aa  191  4e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  27.18 
 
 		 762 aa  191  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  29 
 
 		 795 aa  191  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.66 
 
 		 759 aa  190  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  26.71 
 
 		 749 aa  190  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.16 
 
 		 673 aa  190  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  29 
 
 		 795 aa  189  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  27.06 
 
 		 721 aa  189  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  26.06 
 
 		 731 aa  189  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  27.58 
 
 		 789 aa  189  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  27.01 
 
 		 807 aa  188  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  26.27 
 
 		 722 aa  188  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.29 
 
 		 765 aa  188  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.36 
 
 		 751 aa  187  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.36 
 
 		 747 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  27.91 
 
 		 768 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  29.55 
 
 		 760 aa  187  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  25.61 
 
 		 727 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  27.52 
 
 		 696 aa  187  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  27.36 
 
 		 751 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  26.92 
 
 		 721 aa  186  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  28.37 
 
 		 706 aa  186  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  26.84 
 
 		 724 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.36 
 
 		 747 aa  186  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  27.44 
 
 		 753 aa  186  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.48 
 
 		 713 aa  185  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.44 
 
 		 751 aa  186  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.51 
 
 		 742 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  26.44 
 
 		 682 aa  185  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.87 
 
 		 753 aa  185  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  29.28 
 
 		 787 aa  185  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.36 
 
 		 751 aa  185  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.73 
 
 		 753 aa  184  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  28.9 
 
 		 790 aa  184  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  24.83 
 
 		 689 aa  183  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.9 
 
 		 737 aa  183  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.43 
 
 		 747 aa  184  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  26.24 
 
 		 764 aa  184  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 		 755 aa  184  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.26 
 
 		 858 aa  183  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.22 
 
 		 795 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.35 
 
 		 858 aa  183  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  23.93 
 
 		 769 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  28.49 
 
 		 800 aa  182  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1786  UvrD/REP helicase  28.86 
 
 		 753 aa  181  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.13 
 
 		 741 aa  181  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  27.98 
 
 		 797 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  27.96 
 
 		 817 aa  181  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 		 1019 aa  181  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.86 
 
 		 685 aa  181  9e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  27.02 
 
 		 739 aa  180  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  26.57 
 
 		 735 aa  180  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.58 
 
 		 768 aa  180  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.19 
 
 		 729 aa  179  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.62 
 
 		 731 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  28.11 
 
 		 728 aa  179  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.6 
 
 		 729 aa  179  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.16 
 
 		 786 aa  179  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.7 
 
 		 794 aa  179  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.03 
 
 		 892 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 		 663 aa  178  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.65 
 
 		 686 aa  178  5e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  27.2 
 
 		 816 aa  178  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.17 
 
 		 725 aa  177  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.99 
 
 		 797 aa  177  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.17 
 
 		 758 aa  177  8e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  26.67 
 
 		 727 aa  177  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.59 
 
 		 751 aa  177  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 		 845 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.28 
 
 		 781 aa  177  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.49 
 
 		 755 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  25.79 
 
 		 723 aa  177  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  24.09 
 
 		 681 aa  177  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.43 
 
 		 765 aa  176  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.48 
 
 		 829 aa  177  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 		 762 aa  177  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0795  UvrD/REP helicase  27.87 
 
 		 639 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.790736  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  30.26 
 
 		 770 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.45 
 
 		 751 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  25.06 
 
 		 735 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.86 
 
 		 768 aa  176  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.25 
 
 		 773 aa  175  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  29.27 
 
 		 804 aa  175  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>