More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0795 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0795  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 639 aa  1295    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.790736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  32.27 
 
 		 744 aa  257  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  32.3 
 
 		 845 aa  257  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  32.12 
 
 		 738 aa  256  9e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.02 
 
 		 738 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.01 
 
 		 742 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  32.78 
 
 		 768 aa  253  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  30.68 
 
 		 755 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.08 
 
 		 772 aa  251  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  32.88 
 
 		 779 aa  249  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  34.05 
 
 		 742 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  31.42 
 
 		 738 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  32.06 
 
 		 678 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  31.31 
 
 		 769 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.45 
 
 		 785 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  31.62 
 
 		 787 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  30.72 
 
 		 749 aa  244  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.81 
 
 		 751 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  32.02 
 
 		 736 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.52 
 
 		 758 aa  243  6e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  32.43 
 
 		 741 aa  242  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.19 
 
 		 755 aa  243  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.89 
 
 		 737 aa  242  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.48 
 
 		 751 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.26 
 
 		 729 aa  239  9e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32 
 
 		 718 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.74 
 
 		 765 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  29.91 
 
 		 666 aa  239  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  31.99 
 
 		 706 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 789 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  30.2 
 
 		 735 aa  238  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  28.66 
 
 		 778 aa  237  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  30.57 
 
 		 765 aa  237  5.0000000000000005e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  31.11 
 
 		 696 aa  237  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  31.77 
 
 		 707 aa  237  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  32.52 
 
 		 728 aa  236  9e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.12 
 
 		 694 aa  236  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  30.49 
 
 		 757 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  31.95 
 
 		 724 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.38 
 
 		 659 aa  235  2.0000000000000002e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.37 
 
 		 729 aa  235  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  31.53 
 
 		 816 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.35 
 
 		 763 aa  235  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  29.29 
 
 		 625 aa  234  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  30.8 
 
 		 678 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  30.04 
 
 		 773 aa  234  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.12 
 
 		 732 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  29.91 
 
 		 787 aa  234  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  29.65 
 
 		 764 aa  233  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  30.11 
 
 		 732 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  32.16 
 
 		 737 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  28.81 
 
 		 679 aa  231  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.18 
 
 		 759 aa  230  5e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  29.73 
 
 		 735 aa  230  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  29.5 
 
 		 731 aa  230  7e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  29.8 
 
 		 735 aa  229  9e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.1 
 
 		 741 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  32.2 
 
 		 790 aa  229  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.67 
 
 		 892 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.82 
 
 		 734 aa  229  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  30.38 
 
 		 741 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  32.12 
 
 		 705 aa  228  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.89 
 
 		 751 aa  227  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.89 
 
 		 747 aa  227  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  30.55 
 
 		 689 aa  226  7e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  30.44 
 
 		 689 aa  226  9e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.89 
 
 		 747 aa  226  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.43 
 
 		 672 aa  226  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  29.33 
 
 		 731 aa  225  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  30.73 
 
 		 714 aa  225  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.59 
 
 		 794 aa  224  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.74 
 
 		 741 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.91 
 
 		 753 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  29.97 
 
 		 807 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.98 
 
 		 753 aa  223  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.59 
 
 		 795 aa  223  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.74 
 
 		 747 aa  223  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  29.74 
 
 		 751 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.57 
 
 		 685 aa  223  8e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  29.74 
 
 		 753 aa  223  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.74 
 
 		 751 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.77 
 
 		 814 aa  223  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.88 
 
 		 730 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.74 
 
 		 751 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.99 
 
 		 669 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.94 
 
 		 690 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.45 
 
 		 669 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.29 
 
 		 669 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  31.55 
 
 		 721 aa  222  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  31.55 
 
 		 721 aa  222  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.19 
 
 		 677 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.66 
 
 		 797 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.45 
 
 		 669 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0253  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.85 
 
 		 669 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  29.19 
 
 		 677 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  29.24 
 
 		 680 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  32.25 
 
 		 800 aa  221  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  31.67 
 
 		 770 aa  221  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  29.95 
 
 		 762 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.19 
 
 		 1023 aa  221  3.9999999999999997e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>