More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1474 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  79.39 
 
 		 684 aa  1149    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  79.39 
 
 		 684 aa  1149    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  68.57 
 
 		 684 aa  972    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  79.39 
 
 		 684 aa  1149    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  79.68 
 
 		 684 aa  1151    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  100 
 
 		 684 aa  1402    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  67.69 
 
 		 685 aa  973    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  79.24 
 
 		 684 aa  1147    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  79.24 
 
 		 684 aa  1148    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  68.71 
 
 		 684 aa  973    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  68.71 
 
 		 684 aa  981    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  77.05 
 
 		 684 aa  1101    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  65.94 
 
 		 685 aa  949    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  77.05 
 
 		 684 aa  1104    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  79.39 
 
 		 684 aa  1149    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  77.19 
 
 		 684 aa  1103    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  77.05 
 
 		 684 aa  1102    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  79.24 
 
 		 684 aa  1147    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  79.39 
 
 		 684 aa  1149    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  67.54 
 
 		 685 aa  971    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  68.71 
 
 		 684 aa  973    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  77.05 
 
 		 684 aa  1100    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  66.23 
 
 		 685 aa  942    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  37.89 
 
 		 699 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  34.48 
 
 		 687 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  35.24 
 
 		 689 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  34.24 
 
 		 689 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  42.44 
 
 		 1042 aa  254  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  41.36 
 
 		 995 aa  248  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  37.25 
 
 		 971 aa  244  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  39.15 
 
 		 1020 aa  243  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  39.88 
 
 		 1004 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  40.19 
 
 		 996 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  40.19 
 
 		 996 aa  238  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  40.25 
 
 		 996 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  35.88 
 
 		 957 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  37.9 
 
 		 1010 aa  205  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  38.33 
 
 		 996 aa  196  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  35.21 
 
 		 978 aa  191  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2360  UvrD/REP helicase  34.92 
 
 		 955 aa  187  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  34.32 
 
 		 917 aa  172  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  36.3 
 
 		 972 aa  170  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  30.42 
 
 		 890 aa  163  8.000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  33.9 
 
 		 914 aa  161  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  26.85 
 
 		 666 aa  138  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  31.17 
 
 		 705 aa  125  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  30.52 
 
 		 768 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  29.83 
 
 		 746 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 714 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  29.28 
 
 		 916 aa  117  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0782  ATP-dependent DNA helicase  29.69 
 
 		 675 aa  117  6.9999999999999995e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  30.17 
 
 		 829 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.19 
 
 		 726 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1255  putative site-specific DNA methyltransferase  29.81 
 
 		 677 aa  115  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  29.12 
 
 		 685 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.25 
 
 		 785 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  29.28 
 
 		 677 aa  113  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.93 
 
 		 781 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.93 
 
 		 781 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  29.56 
 
 		 671 aa  112  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  29.48 
 
 		 745 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 786 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 783 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.12 
 
 		 741 aa  111  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  30.72 
 
 		 646 aa  111  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.5 
 
 		 669 aa  110  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 786 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.93 
 
 		 670 aa  109  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.4 
 
 		 715 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  30.3 
 
 		 743 aa  109  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  28.82 
 
 		 787 aa  109  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  27.7 
 
 		 634 aa  108  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.96 
 
 		 667 aa  108  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  30.05 
 
 		 668 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.71 
 
 		 783 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.63 
 
 		 773 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0961  UvrD/REP helicase  29.69 
 
 		 679 aa  108  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.01 
 
 		 671 aa  107  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  29.68 
 
 		 678 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3990  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.32 
 
 		 670 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4106  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.99 
 
 		 685 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  29.06 
 
 		 757 aa  107  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  29.41 
 
 		 790 aa  107  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.81 
 
 		 672 aa  107  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 		 814 aa  107  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 		 678 aa  107  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  27.01 
 
 		 655 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  28.41 
 
 		 1019 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3913  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.59 
 
 		 670 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  29.01 
 
 		 725 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  28.49 
 
 		 678 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.22 
 
 		 682 aa  107  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4012  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.59 
 
 		 670 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>