More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1214 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  65.94 
 
 		 684 aa  956    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  65.94 
 
 		 684 aa  956    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  72.51 
 
 		 685 aa  1043    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  70.32 
 
 		 684 aa  1016    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  71.2 
 
 		 684 aa  1017    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  67.11 
 
 		 684 aa  959    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  66.23 
 
 		 684 aa  927    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  66.81 
 
 		 684 aa  957    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  66.96 
 
 		 684 aa  956    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  65.79 
 
 		 684 aa  956    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  76.93 
 
 		 685 aa  1107    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  73.68 
 
 		 685 aa  1065    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  100 
 
 		 685 aa  1409    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  70.32 
 
 		 684 aa  1016    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  65.94 
 
 		 684 aa  955    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  65.94 
 
 		 684 aa  956    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  70.32 
 
 		 684 aa  1016    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  66.08 
 
 		 684 aa  956    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  65.79 
 
 		 684 aa  954    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  66.67 
 
 		 684 aa  955    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  66.96 
 
 		 684 aa  958    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  65.79 
 
 		 684 aa  954    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  65.94 
 
 		 684 aa  956    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  36.39 
 
 		 699 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  34.9 
 
 		 689 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2134  DNA helicase IV  34.62 
 
 		 687 aa  388  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0277838  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  34.19 
 
 		 689 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  42.68 
 
 		 1042 aa  263  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  39.94 
 
 		 971 aa  254  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  39.46 
 
 		 1020 aa  249  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  40.25 
 
 		 995 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  38.79 
 
 		 996 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  39.39 
 
 		 996 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  39.88 
 
 		 996 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  38.79 
 
 		 1004 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  33.57 
 
 		 957 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  40.39 
 
 		 978 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  36.18 
 
 		 1010 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  39.79 
 
 		 996 aa  209  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2360  UvrD/REP helicase  33.52 
 
 		 955 aa  200  7e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  38.41 
 
 		 972 aa  187  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  34.53 
 
 		 914 aa  177  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  31.62 
 
 		 917 aa  174  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  31.54 
 
 		 890 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  26.48 
 
 		 666 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  30.94 
 
 		 916 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  31.78 
 
 		 725 aa  117  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.88 
 
 		 726 aa  117  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  30.11 
 
 		 705 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.98 
 
 		 785 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  31.69 
 
 		 829 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  31.36 
 
 		 726 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  27.42 
 
 		 676 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  31.47 
 
 		 743 aa  114  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  30.81 
 
 		 786 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  30.81 
 
 		 786 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  28.45 
 
 		 625 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  28.53 
 
 		 746 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  30.36 
 
 		 659 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.49 
 
 		 671 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  28.81 
 
 		 681 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 807 aa  111  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  31.18 
 
 		 783 aa  111  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.37 
 
 		 932 aa  110  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  28.16 
 
 		 768 aa  111  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.87 
 
 		 787 aa  110  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  30.59 
 
 		 790 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  28.72 
 
 		 846 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  31.36 
 
 		 735 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  29.41 
 
 		 724 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  28.64 
 
 		 788 aa  109  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.88 
 
 		 783 aa  109  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  29.12 
 
 		 724 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  30.59 
 
 		 659 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.35 
 
 		 741 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.07 
 
 		 786 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  28.21 
 
 		 707 aa  108  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  29.41 
 
 		 786 aa  108  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.07 
 
 		 787 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.9 
 
 		 671 aa  108  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0782  ATP-dependent DNA helicase  27.04 
 
 		 675 aa  107  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  27.89 
 
 		 1019 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  28.72 
 
 		 787 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  30.42 
 
 		 646 aa  107  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  27.3 
 
 		 714 aa  107  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  28.72 
 
 		 840 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  30.12 
 
 		 744 aa  107  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  27.64 
 
 		 816 aa  107  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  28.07 
 
 		 787 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  28.07 
 
 		 787 aa  107  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  29.72 
 
 		 787 aa  106  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0868  putative ATP-dependent DNA helicase  25.92 
 
 		 676 aa  106  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  24.93 
 
 		 735 aa  106  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0961  UvrD/REP helicase  26.27 
 
 		 679 aa  106  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  25.24 
 
 		 684 aa  105  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  27.54 
 
 		 653 aa  105  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.09 
 
 		 715 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  27.14 
 
 		 639 aa  105  3e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.61 
 
 		 773 aa  105  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 		 669 aa  105  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>